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有難うございます 削除/引用 No.4186-4 - 2007/05/10 (木) 16:26:51 - ススマナイ geneさん、Tさん早速のアドバイス有難うございました。 両方のサイトともに目的の遺伝子の各臓器や細胞における相対的な発現比を閲覧できました。 非常に助かりました。 これを機に、いろんなデーターベースを使いこなせるよう勉強したいと思います。

(無題) 削除/引用 No.4186-3 - 2007/05/10 (木) 12:34:03 - gene NCBIにGEO (Gene Expression Omnibus)というデータベース・検索システムがあります。 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/ マイクロアレイでしらべた、ヒト・マウスなどの発現プロファイルを見ることができます。 Profileの検索キーに、遺伝子名と、必要なら対象とする臓器名や生物種名などをいれて検索してみてください。

(無題) 削除/引用 No.4186-2 - 2007/05/10 (木) 12:16:06 - T http://genome.ucsc.edu/cgi-bin/hgGateway?hgsid=92047703&clade=vertebrate&org=Mouse&db=0 なんてどうでしょう？

ある遺伝子の各組織における発現量を調べるデーターベースは？ 削除/引用 No.4186-1 - 2007/05/10 (木) 12:01:16 - ススマナイ ある遺伝子のマウス脾臓、心臓や睾丸などの各組織における発現比を調べることができるデーターベースをどなたかご存知ないでしょうか？ 当方、C57BL/6Jマウス脾臓由来cDNAを用いてPCRによりある遺伝子を増幅しようとしたのですが発現量が低いせいか非特異的なゲノムDNAの方が効率よく増幅され困っております。 DNAseI処理したRNAを用いたり、プライマーの長さを変えたりしたのですが駄目です（non-RTとRTとで増幅に差が見られず、運の悪いことにゲノム由来の産物が目的と同じサイズにバンドとして出現する）。増幅部位が限定される為、イントロンを挟んだプライマーも作製でません、、、、。そこで、発現量の高い臓器を用いて再度実験をおこなおうとしているのですが、臓器における発現比を調べる為のデーターベースが分からず困っております。

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