Bio Technical フォーラム

  • 書き込みがかなり増えてしまいサーバーの負荷が大きくなったので、新しいBioTechnicalフォーラムに移行してください。
  • 新しいトピックは新フォーラムでのみ立ち上げ可能です。レスもつけられません。

トピック一覧 | 研究留学ネットに戻る

最新のフォーラム | この次のフォーラム(readのみ) | このフォーラム(readのみ)

このスレッドをはてなブックマークに追加このスレッドをはてなブックマークに追加

宮崎DIGEについて トピック削除
No.4353-TOPIC - 2007/06/05 (火) 17:47:11 - hiromix
現在、GE Healthcare社のCyeDyeを用いてタンパクをラベルし、二次元電気泳動を行うことを考えていますが、コストが高いのが難点です。

宮崎大学の先生が、色々な蛍光色素でタンパクのラベルを試してみたところCyDyeと同じようにラベルでき、スポット解析が可能な系を開発したという話を小耳に挟んだのですが、どなたか詳しくご存知の方いらっしゃいませんか?

また、GEのCyDyeを使っていて、コスト削減のためDyeの量をこれだけ減らしても問題なかった、など情報お持ちの方がいたら教えていただけないでしょうか?
(テストランは、GE推奨のタンパク50ugに対し、Dye 400pmolでやってます。)
 
- このトピックにメッセージを投稿する -



5件 ( 1 〜 5 )  前 | 次  1/ 1. /1


ありがとうございます 削除/引用
No.4353-5 - 2007/06/08 (金) 18:33:24 - hiromix
貴重な情報ありがとうございます。
GEのCyDyeは手間はかからない分コストがすごいですよね。
泳動自体はかなり上手になってきたので、なんとか低コストで良い結果を出したいと思ってます。

また情報がありましたら、教えていただけると助かります。

今後使う予定ありです 削除/引用
No.4353-4 - 2007/06/07 (木) 10:22:48 - 武者修行
榊原先生のmethod今後実際に使われてる方に教えていただく予定なので使ってみたらまた書き込みますね。榊原先生のmethodですが現在はリン酸化タンパクの検出なども検討しています。
確かに1枚の検出で100円足らずというのは魅力的ですよね。

今後使う予定ありです。 削除/引用
No.4353-3 - 2007/06/07 (木) 10:18:16 - 武者修行

その後の進展は知りませんが・・・ 削除/引用
No.4353-2 - 2007/06/06 (水) 21:13:04 - プロテオ
2年前に九州バイオサイエンスシンポジウムのポスターで見ました。
宮崎大学・農 榊原陽一先生の方法では。

この時の方法は、
IC3-O-SuとIC5-O-Su(ドージン)を使ってリジン残基のアミノ基をラベル。
ラベル後、クリーンアップキット(バイオラッド)を使って、2D。
一次元目:IEFセル(バイオラッド)で、pH 3-10のIPGストリップ使用
蛍光イメージの取得:ProEXPERSS 2D(パーキンエルマー)および
          モレキュラーイメージャーFX(バイオラッド)

IC3-O-Su(ex.540nm, em.590nm): 550/570
IC5-O-Su(ex.625nm, em.680nm): 640/660
左は抄録の数字で、右は発表者に聞いたメモ


イメージ解析ソフト:Progenesisi(パーキンエルマー)および
          PDQuest(バイオラッド)

内部標準ゲルイメージで補正することにより統計的に定量解析できると書かれています。
パーキンエルマー、バイオラッドへ問い合わせても良いかもしれませんね。

宮崎DIGEについて 削除/引用
No.4353-1 - 2007/06/05 (火) 17:47:11 - hiromix
現在、GE Healthcare社のCyeDyeを用いてタンパクをラベルし、二次元電気泳動を行うことを考えていますが、コストが高いのが難点です。

宮崎大学の先生が、色々な蛍光色素でタンパクのラベルを試してみたところCyDyeと同じようにラベルでき、スポット解析が可能な系を開発したという話を小耳に挟んだのですが、どなたか詳しくご存知の方いらっしゃいませんか?

また、GEのCyDyeを使っていて、コスト削減のためDyeの量をこれだけ減らしても問題なかった、など情報お持ちの方がいたら教えていただけないでしょうか?
(テストランは、GE推奨のタンパク50ugに対し、Dye 400pmolでやってます。)

5件 ( 1 〜 5 )  前 | 次  1/ 1. /1


パスワードを入力してチェックした記事を チェックした記事を

このトピックにメッセージを投稿する
名前 
メール   アドレス非公開
   タイトル 
本文      
設定  クッキーを保存(次回の入力の手間を省けます)
上に上げない(トピックの一覧で一番上に移動させません)
解決(問題が解決した際にチェックしてください)
暗証  半角英数字8-12文字の暗証番号を入れると、あとで削除、修正ができます。
送信 

〔使い方〕
  • 「アドレス非公開」をチェックすれば、自分のメールアドレスを公開しないで他の方からメールを受け取れます。
  • 問題が解決した際には、解決ボタンをチェックして解決した旨のコメントをつけてください。これは、初めにトピックを作った人と管理人のみが可能です。
  • 半角カタカナ、機種依存文字(全角ローマ数字、○の中の数字等)は文字化けの原因となりますので使わないでください。