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(無題) 削除/引用 No.4356-4 - 2007/06/06 (水) 02:08:30 - page 失念しておりましたが、SWISS-MODELはより良いサイトだと思います。http://swissmodel.expasy.org/ 自分で作成したアラインメントを利用することも可能です。

(無題) 削除/引用 No.4356-3 - 2007/06/05 (火) 23:20:18 - PAGE ファイアーなんかどうでしょう。結構いいです。 http://www.sbg.bio.ic.ac.uk/phyre/ 問題点は、立体構造が既知のタンパク質とホモロジーモデリングしてくれます が、ミスアラインメントも多々起こります。ポイントミューテーションや、 ミスアラインメントを正しいとされるものに変換するのは、フリーです とDeep Viewでできます。 http://expasy.org/spdbv/

(無題) 削除/引用 No.4356-2 - 2007/06/05 (火) 20:20:10 - Ｔ 分子モデリングや molecular modeling で検索すれば多くのサイトがヒットすると思います。 http://www.h6.dion.ne.jp/〜k-sugino/ のように、パソコン上でフリーウェアを用いて計算する事も可能です。 結果の信頼性については分かりません。

蛋白の三次元構造 削除/引用 No.4356-1 - 2007/06/05 (火) 19:54:37 - うま ある酵素の遺伝子の変異が、その酵素の蛋白構造にどのような影響を与えるかをシュミレーションしたいと思っています。 1000aa程の大きさのタンパク質の３次元構造を計算してくれるwebサイトなどがありますでしょうか？（自分で探した限りは見つかりませんでしたし、それぞれの蛋白の構造をダウンロードできるというところがあるくらいなので、簡単に計算できるということではないのでしょうか？） やはり、そのようなことが容易にできない場合、なにかよい手はありますでしょうか？ 大変初歩的な質問ですが、よろしくお願いします。

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