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SDS-PAGE(FETUIN) トピック削除
No.4408-TOPIC - 2007/06/14 (木) 00:34:35 - sdf
フェツインをSDS-PAGEで流したのですが、SDS-PAGE上での見かけの分子量が、アミノ酸配列から計算した理論分子量より大幅に大きいのです。フェツインの糖鎖の分子量はわからないのですが、糖鎖の分を加算したとしても大きくなり過ぎているような気がします。
どなたかご存知の方、ご教授お願い致します。
 
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追記 削除/引用
No.4408-3 - 2007/06/14 (木) 17:35:10 - sdf
書き忘れていましたが、泳動したのはBovine fetuinです。
理論分子量は36330で、結合している糖鎖はN-型が3本、O型が3-4本だと思います。
酒多飲さんありがとうございます。糖鎖がたくさん結合していると、負に荷電しにくくなり、移動度が小さくなると考えて宜しいでしょうか?

不思議ですね 削除/引用
No.4408-2 - 2007/06/14 (木) 10:25:29 - 酒多飲
糖鎖はO型が3本、N型が6本ついてますから、
+15kDaくらいで60kDaあたりにバンドが出るはずですが、、、

Lowry で定量しても予想の 40% くらいの値が出ますし、、、

たぶん糖鎖が邪魔で SDS がつきにくくて、
マイナスチャージが足りないのが原因かと思っています。

SDS-PAGE(FETUIN) 削除/引用
No.4408-1 - 2007/06/14 (木) 00:34:35 - sdf
フェツインをSDS-PAGEで流したのですが、SDS-PAGE上での見かけの分子量が、アミノ酸配列から計算した理論分子量より大幅に大きいのです。フェツインの糖鎖の分子量はわからないのですが、糖鎖の分を加算したとしても大きくなり過ぎているような気がします。
どなたかご存知の方、ご教授お願い致します。

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