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細胞周期同調の確認方法 トピック削除
No.4434-TOPIC - 2007/06/19 (火) 09:16:05 - あべちゃん
細胞をチミジンブロックなどで同調しようと考えています。しかし、今所属する研究施設にはフローサイトメーターが有りません。
同調できたかどうかをサイクリンなどのウエスタンブロットのみで確認することは、不十分だと思いますか?他にも同調を確認する方法やアイデアなどがありましたらご教授願えませんでしょうか?
よろしくお願いします。
 
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negative marker 削除/引用
No.4434-3 - 2007/06/19 (火) 10:15:16 - あべちゃん
通りすがりさん、
アドバイス、ありがとうございます。
negative markerを示すことで他のphaseの細胞が居ない事を示す証拠になるという指摘、参考にさせて頂きたいと思います。

(無題) 削除/引用
No.4434-2 - 2007/06/19 (火) 10:06:44 - 通りすがり
>同調できたかどうかをサイクリンなどのウエスタンブロットのみで確認すること
>は、不十分だと思いますか?

自分のとこもFACSがないので同様の問題を抱えております。

FACSの場合、サンプルの細胞集団全体での同調がうまくいてるかどうかを
見れる利点がありますので、そこがウエスタンだけとかだとうまく示せない部分があるので気をつけています。
サイミジンの場合はとくに1回ぐらいだと全体が同じとこではとまりにくいので、特に注意が必要です。

自分の場合はサイクリンやRbのリン酸化やPCNAあるいはBrdUの取り込みなどで免疫染色を行って、なるべく広い視野で多くの細胞の状態がわかるように写真などをとって示したりして、さらにウエスタンブロットなどで、サイクリンの発現などを検出したりしています。

この場合は同調したstageにpositiveなmarker(G1サイクリンとかRbの状態)だけでなく、negativeなもの(G2期やM期のmarker:CyclinBやヒストンのリン酸化とかが検出されないこと)を一緒に示すようにして、できるだけ全体で同調されているのだ、というところを示す必要があります。
あとはリリースしてみてきちんと全体のmarkerなどがshiftしていく部分を示して細胞がおかしくなったりしてないということを出したりもしてますね。

ただこれらだけではFACSのPIで測定するようなDNA量での確認はできないのが難点ですね、細胞の種類によってはサイクリンとかって必ずしも、発現がサイクリックになってなかったりpeakのstageが若干ずれてたりすることあるので、DNAの量とかで見れるのが一番、確実なのでしょうけど。

あとFACSならsubG1などを見てapoptosisになってないことなども示せるので、やっぱりあったらいいなあと思いますが。

細胞周期同調の確認方法 削除/引用
No.4434-1 - 2007/06/19 (火) 09:16:05 - あべちゃん
細胞をチミジンブロックなどで同調しようと考えています。しかし、今所属する研究施設にはフローサイトメーターが有りません。
同調できたかどうかをサイクリンなどのウエスタンブロットのみで確認することは、不十分だと思いますか?他にも同調を確認する方法やアイデアなどがありましたらご教授願えませんでしょうか?
よろしくお願いします。

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