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ChIPについて トピック削除
No.4461-TOPIC - 2007/06/25 (月) 17:38:51 - yuki
現在、ORC2の結合をChIPで確認しているのですが、
全くPCRで増幅してくれません。(Inputではちゃんと増幅します)
論文などではしっかりと検出されているのですが私がやると。。
使用している抗体で免疫沈降できるかは既に確認済みです。

まだ、始めたばかりでいろいろ右も左もわからない状態です。
どなたかご指南いただけましたらよろしくお願いします。

ちなみに細胞は1×10^7で1%PFAで15分固定して行っています。
 
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(無題) 削除/引用
No.4461-2 - 2007/06/27 (水) 21:14:07 - a
ゲノムの切断具合ではPCRかからないこともあると思います

ソニケーションで切断していますか?
何bpまで切断していますか?

ChIPについて 削除/引用
No.4461-1 - 2007/06/25 (月) 17:38:51 - yuki
現在、ORC2の結合をChIPで確認しているのですが、
全くPCRで増幅してくれません。(Inputではちゃんと増幅します)
論文などではしっかりと検出されているのですが私がやると。。
使用している抗体で免疫沈降できるかは既に確認済みです。

まだ、始めたばかりでいろいろ右も左もわからない状態です。
どなたかご指南いただけましたらよろしくお願いします。

ちなみに細胞は1×10^7で1%PFAで15分固定して行っています。

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