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ナイロンメンブレンへの電気的転写法について トピック削除
No.4564-TOPIC - 2007/07/18 (水) 14:24:48 - センター
いつもお世話になっております。私は現在EMSAを目的とした実験を行なっております。そこで、PAGE電気泳動後のDNAをポジティブチャージナイロンメンブレンへセミドライタイプのブロッターで転写しようとしておりますが、方法や条件等がよく分かりません。ウエスタンと同様に行なうらしいのですが、ゲルを挟み込むろ紙は何枚くらい使い、どのような液に浸すのか、単位面積当たりの電流(タンパクの場合は確か2から3mAくらいで60−90分だったような)はいくら位で時間はどれくらい行なえば良いのでしょうか?どなたかナイロンメンブレンへの転写を経験したことのある方、大変申し訳ありませんが御指導願えないでしょうか?よろしく御願いします。
 
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ありがとうございました 削除/引用
No.4564-5 - 2007/07/26 (木) 14:00:50 - センター
ありがとうございました。大変参考になりました。

(無題) 削除/引用
No.4564-4 - 2007/07/19 (木) 21:53:21 - カナマイシン
>K様
ありがとうございました。
確かにいろいろ調べてみると、短い断片の分離はTBEの方が良いというのが定説みたいですね。
こちらでも調べて勉強になりました。
EMSAは・・・まあ今のところTAEでいいかな。
ただ熱が出にくいのはいいですね。TBE。

(無題) 削除/引用
No.4564-3 - 2007/07/18 (水) 16:32:39 - K
ゲルシフトアッセイはやったことがないのですが
聞いた話では、TAEよりもTBEの方が分離能がよい、らしいです。
あと、TAEの発熱を嫌がって、TBEにするケースもあるようです。

(無題) 削除/引用
No.4564-2 - 2007/07/18 (水) 15:07:39 - カナマイシン
ロシュのDIGゲルシフトのマニュアルが詳しいですよ。
DIG Gel Shift Kit, 2nd Generation
http://www.roche-biochem.jp/catalog/manualPage.php?product=3.6.12.1.11.2
↑日本語版もあってとても便利ですが、日本語版はしばしば間違ってます(何mMとか)。

というわけで、私はこれにほぼ従ってます。
ろ紙は 4 枚上下、ブロットはミニゲルあたり400 mA, 30 minです。
バッファーはゲル組成の関係上TBEでなくてTAEでやってますが。

ゲルシフトでTBEを使う利点て何ですかね?
完全に横槍ですがご存知ならどなたか教えてください。

ナイロンメンブレンへの電気的転写法について 削除/引用
No.4564-1 - 2007/07/18 (水) 14:24:48 - センター
いつもお世話になっております。私は現在EMSAを目的とした実験を行なっております。そこで、PAGE電気泳動後のDNAをポジティブチャージナイロンメンブレンへセミドライタイプのブロッターで転写しようとしておりますが、方法や条件等がよく分かりません。ウエスタンと同様に行なうらしいのですが、ゲルを挟み込むろ紙は何枚くらい使い、どのような液に浸すのか、単位面積当たりの電流(タンパクの場合は確か2から3mAくらいで60−90分だったような)はいくら位で時間はどれくらい行なえば良いのでしょうか?どなたかナイロンメンブレンへの転写を経験したことのある方、大変申し訳ありませんが御指導願えないでしょうか?よろしく御願いします。

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