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Re: 削除/引用 No.1083-2 - 2008/05/05 (月) 23:13:23 - AC 　一般的に、突然変異率の高い座位ほどヘテロ接合度が高いと解釈していますが、この値があまりに小さいということは、SNPのminor alleleの頻度が低いと思われ(例えば100人中1人とか)、そのようなSNPは、連鎖解析や連鎖不平衡解析には向いていないんじゃないでしょうか。 　なので、SNPを絞り込みたいといったニーズであれば、このheterozygosityが高いものを優先的に選ぶと良いとは思いますが、この値はかなり人種差があると思いますので、日本人なら、日本人のデータベースも参考にすると良いのでは。

SNPでのheterozygosity? 削除/引用 No.1083-1 - 2008/05/05 (月) 20:59:37 - クマクマ NCBIでSNP検索をしていたのですが、 例えば ttp://www.ncbi.nlm.nih.gov/SNP/snp_ref.cgi?locusId=7157 で、heterozygosityのところに0.011や0.010のように数値がありますよね？この数値がGenotype detailでのヘテロ接合性の平均値であるようだ（これも解釈まちがってるかもですが・・）ということはわかってきたんですが、この数値が意味するところがよく理解できません。0.1や0.5という数値から何が読み取れるのでしょうか？よろしくご教授お願いします！

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