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(無題) 削除/引用 No.1300-6 - 2008/06/10 (火) 20:27:54 - AP >NCBI等のゲノムのデータベースを見ると＋鎖の遺伝子と−鎖の遺伝子がありますが、 + strand, - strandという表記がNCBIのデータ記述に本当にありますか？ + strand, - strandはRNA virusの場合は正規な表記方法として存在しますが、 sense strand、template strandの意味で使うのは少なくとも公式には通用しません（もっともGenbankではsense strand, antisense strandという表記もされていないと思いますが）。 実際、どんなデータエントリーを見て、なにを問題にしているのでしょうか。 ゲノム配列で、染色体に対する相対的な向きが分かっている場合は、それに合わせて一定方向にそろえて、向きが分かっていない場合は任意の方向でデータベースに登録されていると思います。その配列の中に向きの違う複数の遺伝子がある場合、登録配列とは逆向きの遺伝子には"complement"というannotationがされています。

無題 削除/引用 No.1300-5 - 2008/06/10 (火) 20:27:33 - FX よくわかりました。ありがとうございます。

(無題) 削除/引用 No.1300-4 - 2008/06/10 (火) 20:15:28 - 留学予定 かいつまんでに言うと DNAを横に描いた場合 上の鎖から右方向に転写される遺伝子は＋鎖に遺伝子が入っていることになります。 下側の鎖からは左方向に遺伝子が転写されることになりそれはー鎖に遺伝子が入っていることになります。 ＋鎖にある遺伝子からみると＋鎖はセンス、−鎖はアンチセンス。 だから逆にー鎖にある遺伝子からみると＋鎖はアンチセンス、−鎖はセンスとなります。 要するにセンス鎖というのは遺伝子配列を表しており、アンチセンスはそのままの意味で、センス鎖に対して相補的な配列になります。

？？？ 削除/引用 No.1300-3 - 2008/06/10 (火) 20:03:15 - FX 恥ずかしながら知りませんでした。。。ゲノムの＋鎖−鎖といわゆるセンス鎖アンチセンス鎖（これも＋、−で表現しますよね？）っていうのは、また別物って考えていいんでしょうか？モノとしては、ゲノムの＋鎖−鎖がセンス鎖アンチセンス鎖のいずれかである（対応の仕方は遺伝子によって違う、ある遺伝子では＋鎖がセンス鎖で、別の遺伝子では−鎖がセンス鎖である）。。。という考えでいいんでしょうか？それとも、センス、アンチセンスとゲノムの＋、−は全然関係ない、モノとしても全くの別ものなんでしょうか？ゲノムの＋鎖−鎖といわゆるセンス鎖アンチセンス鎖の関係が分からないのですが。

(無題) 削除/引用 No.1300-2 - 2008/06/10 (火) 18:03:48 - ぴゅう 冗談でしょう。 もう少し遺伝学勉強して下さい。 +鎖にも遺伝子が　のかってる場合もあれば、-鎖に乗ってる場合がある。 冗談でしょう。

ゲノムデータベースの＋鎖遺伝子、−鎖遺伝子 削除/引用 No.1300-1 - 2008/06/10 (火) 16:40:57 - FX NCBI等のゲノムのデータベースを見ると＋鎖の遺伝子と−鎖の遺伝子がありますが、これってどういう意味なんでしょうか？+と-で相補的な構造になっていて、転写は−鎖にPolIII等がくっついて起こるんですよね？たまたま実験的にとれてきたのが＋鎖なり、−鎖だった。。。ということなんでしょうか？

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