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(無題) 削除/引用 No.1318-5 - 2008/06/13 (金) 21:27:40 - AP RNase I ならmono-ribonucleatideにまで、できそうですが。 FermentasやAmbionから販売されています。 http://www.fermentas.com/catalog/modifyingenzymes/ribonucleasei.htm http://www.ambion.com/catalog/ProdGrp.html?fkApp=16&fkSubApp=49&fkProdGrp=162 ただし、RNase Iは、5'-Pi, 3'-OHではなく、5'-OH, 2'3'-cyclic Piの末端を生じるらしいです。Alkaline phosphataseは3'-Piも脱リン酸できるようですが、cyclic Piを脱リン酸できるのかどうかわかりません。だとしても、cyclic Piは不安定で酸や金属イオンの存在で簡単に開裂するようですので、処理を工夫すればAlkaline phosphataseを効かせることはできるのではないでしょうか。また、RNase A/T1でできる限り消化して、補助的にRNase Iを使えば2'3'-cyclic Pi末端を減らすことはできるのではないでしょうか。

(無題) 削除/引用 No.1318-3 - 2008/06/13 (金) 11:17:23 - デオキシ 有難うございます。 しかし確認しました所、RNaseA、RNaseT1いずれもendo型ですよね？ Endo型とPhosphodiesteraseIもしくはII等を使用すべきでしょうか？

(無題) 削除/引用 No.1318-2 - 2008/06/12 (木) 18:13:30 - ats exoとendoを組み合わせればよく、RNaseA+RNaseT1だったと思う(未確認）。取り急ぎ。

RNA完全消化 削除/引用 No.1318-1 - 2008/06/12 (木) 17:18:59 - デオキシ 酵素消化によって、RNAを｢完全｣に個々のヌクレオシドまで 分解したいと思っております。当然フォスファターゼ等も必要になるかと 思いますが、どのような酵素の組合せで実現可能でしょうか？ 教えて頂けますと幸いです。

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