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(無題) 削除/引用 No.1632-3 - 2008/07/25 (金) 08:52:17 - isa ありがとうございます。 ということは、 INPUTに対する比をとれば比較可能ですよね？

http:// 削除/引用 No.1632-2 - 2008/07/24 (木) 23:54:06 - TK-1 プライマーが違えばPCRの効率なんて変わるんですから、そんなこと言えません。コントロールとして、IgGコントロールや、input DNAに対してChIPで落ちてきているDNAがどれだけenrichされているか比較してください。

chipアッセイで異なる領域のアセチル化の違い？ 削除/引用 No.1632-1 - 2008/07/24 (木) 22:58:00 - isa 今、ある遺伝子（遺伝子A）のpromoterのヒストンアセチル化を見ています。ここは、H3抗体でバンドが出ました。そして、別の遺伝子（遺伝子B）のpromoterでは、同じPCRサイクル数をかけてもバンドうっすらとしかでませんでした。 この事実から、「Bのpromoterに比べ、Aのpromoterのほうがよりアセチル化されている」ということっていえるのでしょうか？ 　同じPCR条件（アニーリング温度は違いますが）で行ったからといっても、増幅部位によって、PCR効率も多少はことなるので、単純には比較できないかなとおも思うのですが。もしそうだとすると、CHIP assayでは、異なる領域のアセチル化は比較できないとなるのでしょうか？

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