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(無題) 削除/引用 No.2498-7 - 2008/12/14 (日) 20:04:27 - おお >[Re:5] 関西人じゃんさんは書きました : > 逆に入った場合はexonとintronの向きが異なりますが、 > それによってsplicingが阻害されてしますのですか？ ん、これはエクソンが5'->3'でイントロンが3'->5'になるということでしょうか。 もし、DNAを元にトランスクリプションを行えばそんなRNAは できません。最初から(CAP構造をのぞいて)最後まで5'->3'です。 無理やり化学合成すればできますが、生物が合成できないもの 作っても機能しないだろうと思えませんか? なにか起これば面白いという興味本意ならとめませんが。

(無題) 削除/引用 No.2498-6 - 2008/12/14 (日) 19:54:36 - おお >[Re:5] 関西人じゃんさんは書きました : > なにぶん、splicingについて無知なもので教えていただきたいのですが、 > 逆に入った場合はexonとintronの向きが異なりますが、 > それによってsplicingが阻害されてしますのですか？ > 困ったもんですね、、、、、 5'AGGTTG'3と 5'GTTGGA3'は見た目配列が逆になっているように見えますが 配列が逆になっているのでなくて、全く違う配列です。 ですから5'GTTGGA3'は5'AGGTTG'3として機能いたしません。 文字列だけでなく5'->3'という向きも考えないといけません。 いちどDNAなどが数塩基つながった分子構造を書いた 物をにらめっこしてください。 これはスプライシングに限らず、DNAなど分子生物学 一般的な常識です。

ありがとうございます。 削除/引用 No.2498-5 - 2008/12/14 (日) 19:14:32 - 関西人じゃん なにぶん、splicingについて無知なもので教えていただきたいのですが、 逆に入った場合はexonとintronの向きが異なりますが、 それによってsplicingが阻害されてしますのですか？

(無題) 削除/引用 No.2498-4 - 2008/12/14 (日) 01:58:15 - おお ま、分かんなかったら両方やってみればっていう 解決方法もあるかもね。

(無題) 削除/引用 No.2498-3 - 2008/12/14 (日) 01:36:21 - おお ...GU...と配列を書いた場合....P-5'O-G3'O-P-5'O-U3'O-P-.... したがってGUとUGは違った化学構造を持ちます(上記の記号で 分かりにくいでしょうけど、化学構造を書けば分かると思います)。 また、イントロン5'末端の GUを180度回転させてUGとして反対のエクソンのつなげるということは エクソンは5'-3'のむきで、イントロンは3'-5'の向きという不自然な 形になってしまいますよ。

(無題) 削除/引用 No.2498-2 - 2008/12/13 (土) 21:12:11 - 通りすがり SplicingのDonorやAcceptor配列あるいはsnRNPが どのように機能しているか調べてみてください。自然と答えはでると思います。

splicingの向きについて 削除/引用 No.2498-1 - 2008/12/13 (土) 20:03:56 - 関西人じゃん 遺伝子の中に無理やりintronを入れようと考えています。 このときintronの向きは遺伝子の5'側に5’スプライシング部位、 3'側に3'スプライシング部位というふうに向きをそろえる必要があるのでしょうか？

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