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DNAチップ解析の委託について トピック削除
No.1002-TOPIC - 2011/10/01 (土) 09:06:00 - 電気生理屋さん
毎度、お世話様です。
さて、マウスの遺伝子の網羅的解析を計画していますが、機器や試薬が揃っておりません。そこで、解析の委託を考えています。
委託内容は、
1.発現変動で概日リズムがみられる遺伝子の抽出
2.1.の遺伝子の生物学的機能解析
です。
これらの解析を安く行ってくれる企業をご存じないでしょうか?
宜しくお願いいたします。
 
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(無題) 削除/引用
No.1002-3 - 2011/10/04 (火) 09:29:56 - ~
サンプル数や提供できる材料の形、要求内容、ネゴ等で価格は変わってきますので、各社に見積を取ってはいかがでしょうか。

1は単にチップ解析をすればいいわけで、それなりに相場があるでしょうが、
2については内容次第で価格の桁が2個以上変わってくるかと思います。

共同研究については、電気生理屋さんさんが何を提供できるのかが疑問です。
チップ解析ができる研究室にその解析部分だけやって欲しいというのであればいいのですが、
2まで共同研究先にやってもらうというのであれば、電気生理屋さんさんが1stにならない論文しか出ないかもしれません。
金で済ましたほうが安心だと思いますが…

(無題) 削除/引用
No.1002-2 - 2011/10/04 (火) 07:50:25 - Harmonia
1は、トピ主さんが何らかの実験的操作をした細胞や組織から抽出したRNAを供出して、解析を委託するということでしょうか?それとも、実験をするのではなく、iPS遺伝子を見つけたときのように、世の中に出回っているいろいろなデータをかき集めて候補を抽出するということでしょうか?

実験操作を加えたサンプルを解析するとしたら、結構なサンプル数が必要です。むかしからのリズムの世界では、統計的優位さを出すために、10周期分は必要です。1日から4点のサンプリングとして40点。さらに各点5回の繰り返しなら200点。

2は、どのレベルでの実験を考えているでしょうか?
個体でしょうか?細胞でしょうか?タンパク質でしょうか?

そもそも、実験材料は何でしょうか?
ハンドル名から、植物ではないと思いますが、コオロギやゴキブリでしょうか?マウスやラットでしょうか?

そんなこんなで、共同研究先を見つけたほうがいいような気がします。

DNAチップ解析の委託について 削除/引用
No.1002-1 - 2011/10/01 (土) 09:06:00 - 電気生理屋さん
毎度、お世話様です。
さて、マウスの遺伝子の網羅的解析を計画していますが、機器や試薬が揃っておりません。そこで、解析の委託を考えています。
委託内容は、
1.発現変動で概日リズムがみられる遺伝子の抽出
2.1.の遺伝子の生物学的機能解析
です。
これらの解析を安く行ってくれる企業をご存じないでしょうか?
宜しくお願いいたします。

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