いつも勉強させていただいております。
NCBI GEO DATASETに登録されている、ＣＨＩＰ−ＳＥＱのデータを解析する必要がにわかに出てきたのですが、あまり詳しくなく、お知恵をお借りしたく思います。
１．ＧＥＯデータセットから、目的のファイル「GSE?????」をダウンロード
２．IGBゲノムブラウザに取り込んで解析
としたいのですが、データファイルが「.barファイル」だった場合はこの方法で簡単に解析出来ました。
問題は、「.bam」ファイルを用いた時で、「index fileが見つからない」というメッセージが出て取り込むことができません。
調べたところ、「.bamファイル」にはセットで、index file(.baiファイル）が付いてくるようなのですが、NCBIからダウンロードしたファイルには、このindex fileは含まれていません。
bamファイルを用いてindexファイルを作成する方法があるのでしょうか。
それとも全く見当違いのことをやっているのでしょうか。
何らかのアドバイスがいただければたいへん幸いです。 |
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