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細胞あたりの核の数え方 トピック削除
No.133-TOPIC - 2011/03/09 (水) 09:01:21 - gakeppuchi007
マニアックな質問で失礼します。筋分化の研究を行っているものです。筋分化が行われますと細胞同士が融合し細胞1個あたりの核が増えます。そこで、細胞あたりの核をカウントしたいと考えています。画像ファイル(tiff, JPEG)あるいはphotishop (CS4)で保存したデーターはあるのですが、解析するためには、どの様なソフトウエアを用いれば良いかご存知でしょうか。あるいはphotishop (CS4)で行うことも可能なのでしょうか。どなたか方法を教えて頂けないでしょうか。よろしくお願い致します。
 
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No.133-4 - 2011/03/10 (木) 19:59:13 - こうじ
Photoshop CS4でもExtendedならImageJのような
クリックするとカウントできる機能(カウントツール)がついてます。

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No.133-3 - 2011/03/10 (木) 15:22:57 - おお
ImageJ(NIH Image)にクリックすればその場所をマークしてくれてついでにクリックした数をカウントしてくれるマトリックスがあったはず。融合した細胞
の境界とかちゃんと見れるんでしょうか。

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No.133-2 - 2011/03/10 (木) 13:15:51 - tani
あまり参考にはならないと思いますが、顕微鏡を覗きながら片手でカチャカチャと数を数えるに勝る方法はないと思います。染色はHEですか、それとも筋特異的転写因子かなにかの染色ですか。HE染色ならソフトウエアには骨格筋細胞、筋衛星細胞、リンパ球、内皮細胞などを見分ける力はありませんし、数個でも重なったら一個と判断しますから、結局は目的の細胞を目で見て選び出すような地道な努力が必要かと思います。また、後者ならわざわざソフトの力を借りずとも数えられる程度の数ではないかと思いますが。

細胞あたりの核の数え方 削除/引用
No.133-1 - 2011/03/09 (水) 09:01:21 - gakeppuchi007
マニアックな質問で失礼します。筋分化の研究を行っているものです。筋分化が行われますと細胞同士が融合し細胞1個あたりの核が増えます。そこで、細胞あたりの核をカウントしたいと考えています。画像ファイル(tiff, JPEG)あるいはphotishop (CS4)で保存したデーターはあるのですが、解析するためには、どの様なソフトウエアを用いれば良いかご存知でしょうか。あるいはphotishop (CS4)で行うことも可能なのでしょうか。どなたか方法を教えて頂けないでしょうか。よろしくお願い致します。

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