バイオ関連の実験をする上での、試薬、機器、プロトコールなどの情報交換の場です。
新しいテーマで話を始める場合、質問をする場合は「
新しいトピックを作る
」から書き込みをしてください。
質問に対して解答できる方は是非、書き込んで下さい。
このフォーラムにふさわしくないと管理人が判断した投稿は予告なく削除します。
トピック一覧
|
研究留学ネットに戻る
最新のフォーラム
|
このフォーラム
|
ひとつ前のフォーラム(readのみ)
このスレッドをはてなブックマークに追加
qRT-PCRのスタンダード
トピック削除
No.414-TOPIC - 2011/05/20 (金) 11:25:25 - 波平
qRT-PCRの初心者です.
RNAのコピー数を絶対定量で決定したいと思っています.
この時スタンダードRNAのコピー数を10倍毎に振りたいと思っているのですが,
どの様なコピー数の範囲でふるのがよいのでしょうか?
ご教示お願い致します.
むろんRTの効率なども影響するとは思いますが.
一応10〜10の7乗程度のRNAコピーをスタンダードにおきたいと思っています.
サイクルは40サイクルで行う予定です.
-
このトピックにメッセージを投稿する
-
全
5
件 ( 1 〜 5 ) 前 | 次
1
/
1.
/
1
ンンノさんに同意
削除/引用
No.414-5 - 2011/05/26 (木) 11:20:53 - mom-a
10の10乗くらいまではOKだったと思いますが、私は大抵の場合、下は10の2〜4乗、上は7か8乗あたりでやっています。
>大まかな最大コピー数はありそうな気がするのですが
そうですね、あまりにも立ちあがりが早いと安定したベースラインがとれなかったりもするかもしれませんね。でも、上記の条件で大抵は問題ないと思います。
(無題)
削除/引用
No.414-4 - 2011/05/24 (火) 17:10:00 - ンンノ
10の10乗くらいまでは問題ないと思いますが、そんなに発現レベルの高い
遺伝子は殆どないと思いますよ。
定量PCRに関して検量線がブレたり、ヘタったりするのはピペッティングの誤
差とチューブ等への核酸の吸着によるロスです。
(無題)
削除/引用
No.414-3 - 2011/05/23 (月) 19:26:32 - 波平
ご返答ありがとうございます.
例えば,うまく増幅するDNAのqPCRの場合において検量線は,どの程度のコピー数(最大数)までだいたい直線にのるのでしょうか.
やってみないと分からないし,機種によるとは思いますが.
大まかな最大コピー数はありそうな気がするのですが.
(無題)
削除/引用
No.414-2 - 2011/05/20 (金) 13:45:55 - おお
実際に測定するサンプルの中のコピー数をカバーしないと意味がないと思いますけど。。。ピペッティングでぶれない程度に低いところか直線性に問題がない所まで上げてみて、実験系が働く範囲を見極めて、それでサンプルがその範囲内に来るように考えるのがいいのでは。。。
見ようと思っているRNAによっても期待するコピー数は変わってきますよ。
qRT-PCRのスタンダード
削除/引用
No.414-1 - 2011/05/20 (金) 11:25:25 - 波平
qRT-PCRの初心者です.
RNAのコピー数を絶対定量で決定したいと思っています.
この時スタンダードRNAのコピー数を10倍毎に振りたいと思っているのですが,
どの様なコピー数の範囲でふるのがよいのでしょうか?
ご教示お願い致します.
むろんRTの効率なども影響するとは思いますが.
一応10〜10の7乗程度のRNAコピーをスタンダードにおきたいと思っています.
サイクルは40サイクルで行う予定です.
全
5
件 ( 1 〜 5 ) 前 | 次
1
/
1.
/
1
パスワード
を入力してチェックした記事を
チェックした記事を
このトピックにメッセージを投稿する
名前
メール
アドレス非公開
タイトル
本文
設定
クッキーを保存(次回の入力の手間を省けます)
上に上げない(トピックの一覧で一番上に移動させません)
解決(問題が解決した際にチェックしてください)
暗証
半角英数字8-12文字の暗証番号を入れると、あとで削除、修正ができます。
送信
〔使い方〕
「アドレス非公開」をチェックすれば、自分のメールアドレスを公開しないで他の方からメールを受け取れます。
問題が解決した際には、解決ボタンをチェックして解決した旨のコメントをつけてください。これは、初めにトピックを作った人と管理人のみが可能です。
半角カタカナ、機種依存文字(全角ローマ数字、○の中の数字等)は文字化けの原因となりますので使わないでください。