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Y2H-matchmaker gold トピック削除
No.491-TOPIC - 2011/06/07 (火) 17:42:49 - うえお
matchmaker goldの1st screeningをしています。
1stは、AbA 100ng/mlとX-alpha-Galでscreeningです。

一応コロニーはでてきているのですが、X-alpha-Galの分解産物で
青くなっているコロニーは、二つしかありません。

スクリーニングされたコロニー数は、10^7以上、今生えてきているコロニーは、
全部で数千コロニーくらいかなと思います。
30℃培養期間は5日目。とりあえずあと数日培養しようと思います。

baitによるのでしょうが、mellによる呈色反応って、5日培養で
すでに充分なのでしょうか?まだ培養を続ける価値はあるのでしょうか?
 
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(無題) 削除/引用
No.491-3 - 2011/06/07 (火) 21:55:12 - うえお
おおさん、早々にご解答いただきありがとうございます。

いま、ーadeーhisーtrpーleu、xalphaーgal、AbAのプレートを準備しています。
ーadeでは最小培地で赤く色つくと思います。得られたコロニーのうち
半分くらいの大きなコロニーは赤くならず白いままですので、
ご助言を考え、こういうコロニーを中心に2ndスクリーニングを行ってみようかと
思います。

引き続きご経験者の方などからご意見いただければと思います。
よろしくお願いします。

(無題) 削除/引用
No.491-2 - 2011/06/07 (火) 19:48:30 - おお
中にはフォールすポジティブをの物もあると思いますが、X-alpha-Galは比較的感度が低いです。とりあえずプライオリティーをつけるなら発色した2つはまず解析にまわして、残りのクローンは少し強いストリンジェンシー(たのマーカーを加える)に持っていってもいいかもしれません。生えたものすべて解析に回すという力業が可能ならそうでもいいかもしれません。

待てば発色するものもあると思いますが、1次スクリーニングで発色させることが目的というわけでもありませんので、それをふまえて次のステップを考えてみてはどうでしょうか。コロニーをストリークして増やすと、ポピュレーションがちがう(シングルから生えたわけではない)のでそこで発色が確認できる場合もあると思います。

-ade, -hisなどが使えると思います。-his/3ーATでストリンジェンシーを振ってもいいかもしれません。


発色のマーカーはx-beta-galの活性をコロニーレプリカをフィルターに移してから見る方法が一番感度がいいです(ただお使いのシステムにbeta-galの活性が乗っているかは分かりませんけど)。

Y2H-matchmaker gold 削除/引用
No.491-1 - 2011/06/07 (火) 17:42:49 - うえお
matchmaker goldの1st screeningをしています。
1stは、AbA 100ng/mlとX-alpha-Galでscreeningです。

一応コロニーはでてきているのですが、X-alpha-Galの分解産物で
青くなっているコロニーは、二つしかありません。

スクリーニングされたコロニー数は、10^7以上、今生えてきているコロニーは、
全部で数千コロニーくらいかなと思います。
30℃培養期間は5日目。とりあえずあと数日培養しようと思います。

baitによるのでしょうが、mellによる呈色反応って、5日培養で
すでに充分なのでしょうか?まだ培養を続ける価値はあるのでしょうか?

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