Bio Technical フォーラム

  • バイオ関連の実験をする上での、試薬、機器、プロトコールなどの情報交換の場です。
  • 新しいテーマで話を始める場合、質問をする場合は「新しいトピックを作る」から書き込みをしてください。
  • 質問に対して解答できる方は是非、書き込んで下さい。
  • このフォーラムにふさわしくないと管理人が判断した投稿は予告なく削除します。

トピック一覧 | 研究留学ネットに戻る

最新のフォーラム | このフォーラム | ひとつ前のフォーラム(readのみ)

このスレッドをはてなブックマークに追加このスレッドをはてなブックマークに追加

フローサイトメトリーとウエスタンの抗体の違いに付いて トピック削除
No.21-TOPIC - 2011/02/15 (火) 15:51:25 - 川上
はじめて質問をします。
大変基本的な事で恐縮なのですが標題の通り
フローサイトメトリーとウエスタンブロットで使用する抗体には蛍光標識以外に違いがあるのでしょうか?
具体的にはウエスタン用の抗体を用いて目的の光源を標識し、2次抗体で蛍光をつけてフローサイトメトリーで解析すると行った事が可能かどうかが知りたいのです。
どうぞご指導下さい。

旧サーバーの過去のトピックで似た質問が2つほどあったのですが回答を見る事ができませんでした。度々なされた質問であったらすみません。
 
- このトピックにメッセージを投稿する -



6件 ( 1 〜 6 )  前 | 次  1/ 1. /1


(無題) 削除/引用
No.21-6 - 2011/02/16 (水) 10:30:55 - ~
構造の前にエピトープの局在の問題があるかと思います。

エピトープが細胞外にあればいいのですが、
細胞内にあるのであれば透過処理をして抗体が細胞内に入れるようにしないと抗原にアクセスできませんし、
細胞膜内にあれば難しいと思います。

>分子量の小さいタンパクならやってみる価値がありそうですね。
分子量が小さいと、細胞外にあるペプチドも少ないのではないでしょうか。
市販の抗体であれば、エピトープがどこかは明示されていると思いますので、確認してみてはいかがでしょうか。

市販抗体調査 削除/引用
No.21-5 - 2011/02/16 (水) 09:14:38 - mAb
標的抗原に対する市販抗体があれば、数種類調査すべきです。
使用用途がWBもしくはFACS(IP)どちらかに限定されている場合(モノクロでは結構あります)、
抗体のエピトープがリニアorコンフォメーショナルで偏りがあることが考えられます。
会社によってはデータシートの情報も当てにならないことはありますが、参考にはなるかと思います。

丁寧な回答ありがとうございます。 削除/引用
No.21-4 - 2011/02/16 (水) 04:03:09 - 川上
高次構造が失われたウエスタンでのタンパク質に反応する抗体が、
FACSでの立体構造をもったままのタンパク質では必ずしも反応すると言う訳ではないと言う事ですね。
皆さんとてもわかりやすい説明をありがとうございます。
分子量の小さいタンパクならやってみる価値がありそうですね。
初めで質問いたしましたが大変参考になりました。
ありがとうございます。
これからもよろしくお願いします。

抗体次第 削除/引用
No.21-3 - 2011/02/15 (火) 16:39:56 - ats
抗体次第です。
フローサイトメトリーでの抗原は高次構造を形成していますが、ウエスタンブロットでの抗原は変性しているからです。
いわゆるペプチドタグは高次構造を形成しないものが多いので、それに対する抗体はどちらでも使えるものが多いです(そうでないと使い勝手が悪い)。

(無題) 削除/引用
No.21-2 - 2011/02/15 (火) 16:39:02 - ami(偽物)
基本的にwesternで使用できる抗体の[western]を行う場合の前提として、変性しているタンパク質を認識できるということへの信頼です。それがnaiveなタンパク質をも認識できるかはcase by caseです。

また同様にFCMで使用可能とある抗体は少なくともnaiveな構造のタンパク質であり、尚かつ例外を除いて細胞外領域を認識しているということです。

私はそのため、FACSに使用できる抗体はIPにも使用できる可能は十分にあるかと考えています。

フローサイトメトリーとウエスタンの抗体の違いに付いて 削除/引用
No.21-1 - 2011/02/15 (火) 15:51:25 - 川上
はじめて質問をします。
大変基本的な事で恐縮なのですが標題の通り
フローサイトメトリーとウエスタンブロットで使用する抗体には蛍光標識以外に違いがあるのでしょうか?
具体的にはウエスタン用の抗体を用いて目的の光源を標識し、2次抗体で蛍光をつけてフローサイトメトリーで解析すると行った事が可能かどうかが知りたいのです。
どうぞご指導下さい。

旧サーバーの過去のトピックで似た質問が2つほどあったのですが回答を見る事ができませんでした。度々なされた質問であったらすみません。

6件 ( 1 〜 6 )  前 | 次  1/ 1. /1


パスワードを入力してチェックした記事を チェックした記事を

このトピックにメッセージを投稿する
名前 
メール   アドレス非公開
   タイトル 
本文      
設定  クッキーを保存(次回の入力の手間を省けます)
上に上げない(トピックの一覧で一番上に移動させません)
解決(問題が解決した際にチェックしてください)
暗証  半角英数字8-12文字の暗証番号を入れると、あとで削除、修正ができます。
送信 

〔使い方〕
  • 「アドレス非公開」をチェックすれば、自分のメールアドレスを公開しないで他の方からメールを受け取れます。
  • 問題が解決した際には、解決ボタンをチェックして解決した旨のコメントをつけてください。これは、初めにトピックを作った人と管理人のみが可能です。
  • 半角カタカナ、機種依存文字(全角ローマ数字、○の中の数字等)は文字化けの原因となりますので使わないでください。