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プラスミドのコンカテマー トピック削除
No.11435-TOPIC - 2023/05/10 (水) 12:02:42 - dm
別のトピックにも似たような質問があったのですが、プラスミドのトランスフェクションを行っております。

プラスミドを回収すると、コンカテマーが生じているのですが、トランスフェクションへの影響はどの程度になるのでしょうか。

さらにコンカテマーができているということは、この大腸菌をsingle cloneにして、再度増幅させると一定確率で、コンカテマープラスミドを拾ってしまうということもありうるのでしょうか。
 
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No.11435-4 - 2023/05/12 (金) 06:01:40 - おお
>[Re:3] dmさんは書きました :
> 実際にコンカテマー(ダイマーやトリマー)が生じていることが分かりました。

それは制限酵素などで切ってそう判断できたということですか?

実際に2つのプラスミドがつながっていたりしたなら、どこでつながったかで判断しないとわからないのでは?発現ユニットがほぞんされているかということ。

またコンカテマーだけを精製しない限りモノマー(通常のプラスミド)も混じっているだろうし、そちらのほうが複製に有利だと妄想しているので、大腸菌の株とか変えてTFしたらいいのかなと思う。どうしても気になるならモノマーと思われるものをゲルなどから切り出して使ってもいいと思うけど。

(無題) 削除/引用
No.11435-3 - 2023/05/12 (金) 03:20:46 - dm
実際にコンカテマー(ダイマーやトリマー)が生じていることが分かりました。

(無題) 削除/引用
No.11435-2 - 2023/05/12 (金) 03:06:48 - おお
私がコンカテマーと書いちゃってますが、カテナンのつもりでした。むかしはコンカテマーって言ってなかったかなぁ、、、

プラスミドのコンカテマー 削除/引用
No.11435-1 - 2023/05/10 (水) 12:02:42 - dm
別のトピックにも似たような質問があったのですが、プラスミドのトランスフェクションを行っております。

プラスミドを回収すると、コンカテマーが生じているのですが、トランスフェクションへの影響はどの程度になるのでしょうか。

さらにコンカテマーができているということは、この大腸菌をsingle cloneにして、再度増幅させると一定確率で、コンカテマープラスミドを拾ってしまうということもありうるのでしょうか。

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