Bio Technical フォーラム

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1N- NaOHによる細胞の可溶化(タンパク定量用) トピック削除
No.11564-TOPIC - 2023/06/27 (火) 21:48:07 - 大きな木
ヒト凍結肝細胞を培養しております。
そのタンパク定量解析のため,1N‐NaOHで細胞をライセート化しようとしたところ(R.T.☓3Hrs),
細胞がそもそも十分に剥離しなかったり,剥離しても凝集塊が結構,残存しております。

何か,コツや留意点などございましたら,ご教示いただけませんでしょうか。
宜しくお願い致します。
 
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No.11564-7 - 2023/06/30 (金) 06:53:54 - おお
>[Re:6] ゆさんは書きました :
> NaOHで加熱は良くないと思う。ペプチド結合が切れるかもしれないので。

参考にできる文検などありますでしょうか?

(無題) 削除/引用
No.11564-6 - 2023/06/28 (水) 16:26:50 - ゆ
NaOHで加熱は良くないと思う。ペプチド結合が切れるかもしれないので。ペプチド結合は強酸には(ボイルでもしないかぎり)かなり安定だけど、強アルカリにはわりと脆弱だったりします。

(無題) 削除/引用
No.11564-5 - 2023/06/28 (水) 15:45:42 - ドガ
1N とか廃止された単位を使うのはやめましょう。
SI単位を使うこと。
よほど年配の先生に習ってるのかな。

(無題) 削除/引用
No.11564-4 - 2023/06/28 (水) 13:42:29 - srout
タンパク定量したことは無いですが、他の用途でNaOH加えて超音波や加熱するプロトコルは見たことがあります。濃度がその後に影響しないなら2Nとか濃くしたり。

(無題) 削除/引用
No.11564-3 - 2023/06/28 (水) 02:53:41 - あの
NaOHにこだわる必要あるのですか?

(無題) 削除/引用
No.11564-2 - 2023/06/28 (水) 02:24:52 - おお
そういうのはちょっと経験がないのだけど、、、いや、もしかしたらRI関連でやったことあるかもしれない、、、

とにかく張り付いているものはスクレーパではがすしかないでしょう。デブリになっているものは超音波とか、ビーズを使って激しく攪拌して見た目デブリがないくらいにまでして、遠心するか。

細胞を回収してから(PBS中でスクレーパーではがして細胞懸濁液を作ってから遠心して回収)NaOHでLysisするとかできるならそっちのほうがいいかもしれない。

1N- NaOHによる細胞の可溶化(タンパク定量用) 削除/引用
No.11564-1 - 2023/06/27 (火) 21:48:07 - 大きな木
ヒト凍結肝細胞を培養しております。
そのタンパク定量解析のため,1N‐NaOHで細胞をライセート化しようとしたところ(R.T.☓3Hrs),
細胞がそもそも十分に剥離しなかったり,剥離しても凝集塊が結構,残存しております。

何か,コツや留意点などございましたら,ご教示いただけませんでしょうか。
宜しくお願い致します。

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