Bio Technical フォーラム

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RNAseq 解析 トピック削除
No.12774-TOPIC - 2025/01/08 (水) 14:25:22 - う
イルミナのNGSで得た刺激有り無しのバルクのRNAseqデータを自前で発現解析とパスウエイ解析を使用としていますが、オンライン解析できる良いサイトを教えてください。iDEP 2.0を検討していますが、他にも良いサイトがあればご教示いただけると幸いです。
　
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(無題) 削除/引用
No.12774-4 - 2025/01/08 (水) 18:37:08 - あの
Metascapeをおすすめします

https://metascape.org/gp/index.html#/main/step1

次あたりを参考に
　
https://labo-code.com/bioinformatics/enrichment-analysis/

(無題) 削除/引用
No.12774-3 - 2025/01/08 (水) 16:08:58 - う
B6マウスです

(無題) 削除/引用
No.12774-2 - 2025/01/08 (水) 15:35:45 - G25
ちなみに生物種は？
annotation済みのリファレンスが整備されているモデル生物以外だとなかなかに難しい。

RNAseq 解析 削除/引用
No.12774-1 - 2025/01/08 (水) 14:25:22 - う
イルミナのNGSで得た刺激有り無しのバルクのRNAseqデータを自前で発現解析とパスウエイ解析を使用としていますが、オンライン解析できる良いサイトを教えてください。iDEP 2.0を検討していますが、他にも良いサイトがあればご教示いただけると幸いです。
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