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解析したアミノ酸のタンパク質の立体構造予測を行いたい トピック削除
No.12928-TOPIC - 2025/04/19 (土) 17:14:33 - Ｋ
遺伝子解析を行い、新規タンパク質の塩基アミノ酸配列を明らかにしたのですが、この配列からタンパク質の立体構造予測を行いたいのですが、普通のノートＰＣで行える方法はあるのでしょうか。アミノ酸配列はtextファイルに保存されています。

調べてみるとPyMOLやCoLab (AlphaFold2)などがヒットし、使用してみたのですが、PyMOLはPBDファイルが必要で、CoLab (AlphaFold2)は配列がIndex errorという文言が出て立体構造の予測を行うことが出来ませんでした。
　
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(無題) 削除/引用
No.12928-3 - 2025/04/19 (土) 21:25:37 - めめ
教科書読めって回答とGoogleで検索しろって回答はどちらがキツいんだろ？

(無題) 削除/引用
No.12928-2 - 2025/04/19 (土) 17:40:00 - が
用語の使い方がメチャクチャなのは、置いておいて、
AlphaFold3 serverとGoogleで検索してみなさい。

解析したアミノ酸のタンパク質の立体構造予測を行いたい 削除/引用
No.12928-1 - 2025/04/19 (土) 17:14:33 - Ｋ
遺伝子解析を行い、新規タンパク質の塩基アミノ酸配列を明らかにしたのですが、この配列からタンパク質の立体構造予測を行いたいのですが、普通のノートＰＣで行える方法はあるのでしょうか。アミノ酸配列はtextファイルに保存されています。

調べてみるとPyMOLやCoLab (AlphaFold2)などがヒットし、使用してみたのですが、PyMOLはPBDファイルが必要で、CoLab (AlphaFold2)は配列がIndex errorという文言が出て立体構造の予測を行うことが出来ませんでした。
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