Bio Technical フォーラム

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長い相補配列で交換で短い相補配列が結合したDNA（RNA）の鎖交換 トピック削除
No.12943-TOPIC - 2025/05/04 (日) 12:26:26 - おお
たとえば１kbとか長いDNA/RNAに数ベースのオリゴDNA/RNAがアニールしていたとします。アニールした場所を含んだ更に長い相補のオリゴDNA/RNAが共存する時短いオリゴが長いオリゴに置き換わるというのを捉えててデーターにしているような文献をご存知でしたら教えていただけませんか？できれば生理的な環境のほうがいいのですが、それにこだわらなくてもいいです。

安定性（Free energy?）を考えればそらそうだろうと思うのですが、、、
　
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No.12943-5 - 2025/05/15 (木) 01:20:00 - おお
論文ありがとうございました。軽く読んで考えてみたいと思います。

じつは鎖交換について乏しいながらも論文が見つかっている状況です。ですがさらなる情報があればと思ってます。

(無題) 削除/引用
No.12943-4 - 2025/05/14 (水) 17:49:43 - ズコット
この論文の場合、酸解離基の強さの差も有ったりしてオリゴ核酸の交換反応とは別物だが、安定性を実験的に見積もるヒントにはなりそう。

(無題) 削除/引用
No.12943-3 - 2025/05/14 (水) 17:33:35 - ズコット
シングルの核酸鎖での論文はパッと思いつかないが、探せばありそう。
一方が２重DNAで高分子電解質間との複合体だったら、たとえば
https://doi.org/10.1021/js970304s

この手の話はCo-operabilityといって、
土田秀俊（編）高分子集合体（1983）学会出版センター
に詳しい。

(無題) 削除/引用
No.12943-2 - 2025/05/04 (日) 12:27:38 - おお
タイトル変だね
＞長い相補配列で交換で短い相補配列が結合したDNA（RNA）の鎖交換
長い相補配列で短い相補配列が結合したDNA（RNA）の鎖交換

長い相補配列で交換で短い相補配列が結合したDNA（RNA）の鎖交換 削除/引用
No.12943-1 - 2025/05/04 (日) 12:26:26 - おお
たとえば１kbとか長いDNA/RNAに数ベースのオリゴDNA/RNAがアニールしていたとします。アニールした場所を含んだ更に長い相補のオリゴDNA/RNAが共存する時短いオリゴが長いオリゴに置き換わるというのを捉えててデーターにしているような文献をご存知でしたら教えていただけませんか？できれば生理的な環境のほうがいいのですが、それにこだわらなくてもいいです。

安定性（Free energy?）を考えればそらそうだろうと思うのですが、、、
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