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T2Aの後ろに一型膜貫通タンパク質はいけますか? トピック削除
No.12958-TOPIC - 2025/05/21 (水) 00:17:05 - Tick
お世話になります。
エンプティベクターを購入予定ですが、GFP-T2A-MCSのプラスミドがあります。
この時、一型膜貫通タンパク質Aをそのように発現させたいのですが、MCSにはシグナル配列込みのままでいけますか?

なんとなくA(シグナル配列込み)-IRES-GFPが無難なようには思えます。
ご意見をいただけましたら幸いです。
 
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No.12958-5 - 2025/05/22 (木) 02:58:06 - おお
>[Re:4] P2Aさんは書きました :
> いけるかいけないかでいうと、CARとかTCRでいけてる実例(PMC5142425とかPMC8385324、P2Aだけど)があるのでいける可能性はあります。ですが、効率とかミスソーティングとかの問題があるだろうからやってみないとわからないでしょうね。
>

実例があるのですね。ちょっと探してみようかなとおもいつつ、、、

典型的なシグナルペプチドがあるタンパクだとシグナルペプチドがの部分が合成されたあと、一時翻訳がとまりsignal recognition particleに認識されてERに導かれるとありますから、余分に付加されたアミノ酸が邪魔しない限り理屈上では可能かなという推測はしていましたが、それでできるというのは言えないなぁとおもってました。

(無題) 削除/引用
No.12958-4 - 2025/05/21 (水) 10:42:19 - P2A
いけるかいけないかでいうと、CARとかTCRでいけてる実例(PMC5142425とかPMC8385324、P2Aだけど)があるのでいける可能性はあります。ですが、効率とかミスソーティングとかの問題があるだろうからやってみないとわからないでしょうね。

(無題) 削除/引用
No.12958-3 - 2025/05/21 (水) 10:17:04 - AA
2Aは翻訳過程でのスキッピングで前後が開裂する仕組みなので、基本的に非翻訳のシグナルペプチド配列についてはやはり上流側にないとだめなのではないかと思います。

GFPと2Aのいち関係については2A-GFPとなっている方が一般的なきはしますが、一応理屈の上では2AのC末端側のほうはプロリン1個だけの付加なので、17アミノ酸がC末端に付加されるよりは良いということでGFPのほうが前にあるんでしょうか。

(無題) 削除/引用
No.12958-2 - 2025/05/21 (水) 02:35:03 - おお
>GFP-T2A-MCSのプラスミドがあります。
>この時、一型膜貫通タンパク質Aをそのように発現させたいのですが、MCSにはシグナル配列込みのままでいけますか?

やったことがないのでなんとも言えませんね。

>A(シグナル配列込み)-IRES-GFP

普通はそうするんじゃないかと。

http://www.kenkyuu2.net/cgi-biotech2012/biotechforum.cgi?mode=view;start=1;Code=12535
http://www.kenkyuu2.net/cgi-biotech2012/biotechforum.cgi?start=1;mode=view;Code=8139

T2Aの後ろに一型膜貫通タンパク質はいけますか? 削除/引用
No.12958-1 - 2025/05/21 (水) 00:17:05 - Tick
お世話になります。
エンプティベクターを購入予定ですが、GFP-T2A-MCSのプラスミドがあります。
この時、一型膜貫通タンパク質Aをそのように発現させたいのですが、MCSにはシグナル配列込みのままでいけますか?

なんとなくA(シグナル配列込み)-IRES-GFPが無難なようには思えます。
ご意見をいただけましたら幸いです。

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