Bio Technical フォーラム

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ライブイメージングの定量解析について トピック削除
No.13023-TOPIC - 2025/07/05 (土) 16:58:28 - セキタク
いつもお世話になっております。

フォルスコリンなどの薬剤を作用させた後のcAMP動態を調べるために、ライブイメージングを行なっています。HEK細胞に、cAMPモニター分子をtransientに遺伝子導入し、観察しています。

現在困っていることは、このライブイメージングデータの定量方法です。ROIをとってシグナルの経時変化を定量したいのですが、イメージング中に細胞が動くため、ROIから細胞がずれてしまいます。ROIを各フレームごとに設定するのも恣意的かと思いますので、何かいい方法は無いかと探しております。

みなさまはどのようにライブイメージングのシグナル定量を行っておりますでしょうか。説明の不足などありましたら、お聞きくださると嬉しいです。

よろしくお願いします。
 
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(無題) 削除/引用
No.13023-3 - 2025/07/06 (日) 10:37:44 - セキタク
>SN様

Image Jの説明URLをありがとうございます。
そういった目的のプラグインがあるんですね。早速試してみます。

本当にありがとうございます。

(無題) 削除/引用
No.13023-2 - 2025/07/06 (日) 04:46:39 - SN
Image Jで画像のズレを補正するプラグインを使用した後に、ROIを測定するのが良いかと思います。
https://bigwww.epfl.ch/thevenaz/turboreg/

ライブイメージングの定量解析について 削除/引用
No.13023-1 - 2025/07/05 (土) 16:58:28 - セキタク
いつもお世話になっております。

フォルスコリンなどの薬剤を作用させた後のcAMP動態を調べるために、ライブイメージングを行なっています。HEK細胞に、cAMPモニター分子をtransientに遺伝子導入し、観察しています。

現在困っていることは、このライブイメージングデータの定量方法です。ROIをとってシグナルの経時変化を定量したいのですが、イメージング中に細胞が動くため、ROIから細胞がずれてしまいます。ROIを各フレームごとに設定するのも恣意的かと思いますので、何かいい方法は無いかと探しております。

みなさまはどのようにライブイメージングのシグナル定量を行っておりますでしょうか。説明の不足などありましたら、お聞きくださると嬉しいです。

よろしくお願いします。

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