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フローサイトメーターのデータの揺らぎ
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No.13194-TOPIC - 2025/12/30 (火) 09:04:16 - DEM
最近、フローサイトメータで解析をしているのですが、結構値がぶれますね。
ためしに全く同じサンプルを3レーンにわけて、3x6セット流したのですが、
ことの他データの揺らぎがあり、微妙な差の有意差はなかなか取れないという印象です。
正しいでしょうか。
機械的な解析で、かつ多数の細胞を扱うので、ブレは少ないとずっと思っていたのですが、意外でした。
論文で、数%の差を差があると強調している論文がありますが、本当なのか、かなり疑心暗鬼になりました。
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No.13194-2 - 2025/12/30 (火) 12:32:08 - GIN
PI染色でも先と後で解析したサンプルの1Cピークの位置がずれていきますよ。見て分かるから、1Cと呼んでいるだけですが。
フローサイトメトリーといえば、むかしGFP発現するモノクローンをエクスパンドしては”Brightest”クローン採取を数回繰り返した人がいました。なんでも”エピジェネティックな機構”が輝度の差を生む源泉だという話でしたが、”Brightest”ポピュレーションが時間とともに輝きを失っていくのを見るにつけ、平均への回帰をご存知ないと思った記憶があります。いえ、関係ありませんが。
フローサイトメーターのデータの揺らぎ
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No.13194-1 - 2025/12/30 (火) 09:04:16 - DEM
最近、フローサイトメータで解析をしているのですが、結構値がぶれますね。
ためしに全く同じサンプルを3レーンにわけて、3x6セット流したのですが、
ことの他データの揺らぎがあり、微妙な差の有意差はなかなか取れないという印象です。
正しいでしょうか。
機械的な解析で、かつ多数の細胞を扱うので、ブレは少ないとずっと思っていたのですが、意外でした。
論文で、数%の差を差があると強調している論文がありますが、本当なのか、かなり疑心暗鬼になりました。
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