Bio Technical フォーラム

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マウス臓器からのウエスタン トピック削除
No.13215-TOPIC - 2026/02/09 (月) 23:40:11 - PT
教えて欲しいことがあります。
よろしくお願いします。

現在生まれてまもないマウスのあらゆる臓器を摘出し、ウエスタンをして目的のタンパクの発現をみたいです。

脳、肝臓、小腸、肺、腎臓、脾臓、胸腺などトータル10種類取りました。
脾臓は爪楊枝の先端ほどの大きさです。

組織重量によってライシスバッファーを加えて抽出します。
その時の方法について教えてください。

1.5mLチューブに入れた臓器を-150度に凍らせてありますが、それを氷の上で解凍後、すぐに1% トリトンX100の入ったライシスバッファーを加えます。
その後に、ディスポーザブルペッスルシステム(サーモ社)のものでゴリゴリする予定です。
これで十分壊せますでしょうか?もちろんその後に遠心、タンパク定量を行います。

また脳は初めて壊します。
ほとんど脂な気がしますが、タンパク抽出時に気を付けることがありましたら教えていただけませんか。
よろしくお願いします!
 
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(無題) 削除/引用
No.13215-4 - 2026/02/11 (水) 03:25:34 - おお
すごいラフな数字で言うと、1gの組織に100mgぐらいのタンパク質があり、それをWBするのにちょうどよい蛋白濃度で抽出するには30から100mlぐらいのバッファーが必要です。あまりにもバッファーが少なすぎると非常に濃い蛋白濃度になるだけではなく、抽出が不十分になります。いずれにせよタンパク質の抽出を確実にするため一度破砕、遠心したあとのペレットにいくらかバッファーを加えて2度破砕を繰り返したほうが無難です。

また組織では1% トリトンX100では抽出力が弱い場合も多いです目的にもよりますがRIPAや1から2%SDSなどが抽出という観点からは無難です。

>ディスポーザブルペッスルシステム(サーモ社)のものでゴリゴリする予定システム(サーモ社)のものでゴリゴリする予定
これで蛋白が抽出できる組織もありますが、組織は細かくなれどタンパク質が取れるほどの破砕ができない場合もあります。私はグラスビーズを入れたうえでディスポーザブルペッスルでゴリゴリしたりします。

(無題) 削除/引用
No.13215-3 - 2026/02/10 (火) 12:33:10 - 2345
組織量に対してlysis buffer が多すぎると希釈されてタンパク質濃度が低くなりすぎて後の実験で不都合が生じますので注意してください。目分量でもいいのですが大体,体積比で組織1に対してLysis buffer 10ないし20くらいがいい感じと思います。(もし濃度が高すぎたら後で希釈すれば良いので)

肝臓や脳など柔らかい組織は手でも十分ホモジナイズできます。心臓とか筋肉は硬いのであらかじめハサミで細切して凍結し、また小型の電動ホモジナイザーを使用した方がいいいです。組織の硬さに応じて選択してください。

組織は氷の上で解凍してからでなくて、凍結状態で良いので直ちにLysis buffer(プロテアーゼインヒビターを含む)に投入してください。小さい組織片ならば投入したらすぐに解凍しますので速やかにホモジナイズを始めてください。(ホモジナイズしながら解凍する感じ。) 組織が解凍する過程で細胞内の構造が崩壊していろいろなプロテアーゼが働き出しますのでここをいかにして手早くクリアするかは重要です。

Triton XやNP40など非イオン性界面活性剤がベースのlysis bufferでは可溶化できないタンパク質は割とあります。そうしたものはとりわけ核のタンパク質や細胞膜のタンパク質でしばしば見られます。使用する界面活性剤を変えることで可溶化できるタンパク質の種類や量も変わります。1~2%SDSなどの変性能の強いイオン性界面活性剤では、タンパク質の活性は失われますが、ほぼ全てのタンパク質を可溶化できます。研究対象とするタンパク質が今使用しているLysis bufferで十分に可溶化できるかどうかにも留意してください。

脳組織に専用の特別な方法は特にないともいます。他の組織と同様で良いと思います。

(無題) 削除/引用
No.13215-2 - 2026/02/10 (火) 11:54:00 - mont
やったことが無いので無責任な発言なのですが、脾臓と胸腺はピペッティングでいけるのでは。
最初に、200の先端を少しカットしたチップでピペッティング。
次に普通の200のチップでピペッティング。とか。

全体量が少ないと、ペッスルに付着してしまうロスが結構大きいです。潰れたはいいけど、サンプルがペッスルに張り付いてしまってほとんど回収出来ない、という事態になるかも。
脳、肝臓など量が多い臓器は大丈夫だと思います。

小腸も刻んでからペッスル。そのままだと、ペチャンコになった小腸がペッスルと一緒にクルクル回って破砕出来なさそう。

ディスポのペッスルは、あまりゴリゴリ出来ません。チューブの壁に押し付けてクルクル回るだけ、ぐらいに思っていた方がいいです。

本番前に、いらない組織でどのくらいのロスがあるか、試した方がいいですよ。

マウス臓器からのウエスタン 削除/引用
No.13215-1 - 2026/02/09 (月) 23:40:11 - PT
教えて欲しいことがあります。
よろしくお願いします。

現在生まれてまもないマウスのあらゆる臓器を摘出し、ウエスタンをして目的のタンパクの発現をみたいです。

脳、肝臓、小腸、肺、腎臓、脾臓、胸腺などトータル10種類取りました。
脾臓は爪楊枝の先端ほどの大きさです。

組織重量によってライシスバッファーを加えて抽出します。
その時の方法について教えてください。

1.5mLチューブに入れた臓器を-150度に凍らせてありますが、それを氷の上で解凍後、すぐに1% トリトンX100の入ったライシスバッファーを加えます。
その後に、ディスポーザブルペッスルシステム(サーモ社)のものでゴリゴリする予定です。
これで十分壊せますでしょうか?もちろんその後に遠心、タンパク定量を行います。

また脳は初めて壊します。
ほとんど脂な気がしますが、タンパク抽出時に気を付けることがありましたら教えていただけませんか。
よろしくお願いします!

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