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(無題) 削除/引用 No.2678-2 - 2013/12/19 (木) 15:27:50 - AP >（たいていどこかが2mer位不一致） この程度なら、不一致塩基はヒト配列、マウス配列の混合になるようにプライマーをオーダーするんじゃだめなんだろか。degenerateするのは追加料金無しだよな。

異種間でも検出可能なprimerの設計 削除/引用 No.2678-1 - 2013/12/19 (木) 15:08:57 - primer いつも勉強させていただいております。 real time RT-PCRで使うprimerの設計法についてお伺いさせていただきたいと思います。 異種間、例えばhumanとmouseの両方で検出可能なprimerの設計をしたいと思うのですが、 皆様はどのように行っておられますでしょうか。 論文で使用されている配列をhumanとmouseの両方でprimer blastしてみる、 primer3でマウスのmRNA配列を基にprimerを設計し、ヒトとマウスの両方でprimer blastしてみる、 などと行ってみておりますが、 どちらも完全に一致する配列がなかなか出てこず、 （たいていどこかが2mer位不一致） あまりに作業効率が悪いので、 皆様はどのように行っておられるのか気になり、 質問させていただきました。 よろしくお願いいたします。

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