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Ancestral alleleの捉え方 削除/引用 No.3650-1 - 2014/12/11 (木) 10:00:12 - ゆきんこ ある遺伝子の変異率を、算出しようとしてます。 1000 genomesおよびNHLBIのデータを利用していますが、 ancestral alleleのデータは、何を元に計算したらいいのでしょうか？ ancestral alleleをAととれば変異率は1%に逆にCととれば変異率99%になるかと思います。 reference genomeは時々間違いがあります。 dbSNPのデータも類人猿と比較しておかしいなと感じるときもあります。 また類人猿が全てCなのに人ではほとんどAで稀にCになっている場合もあります。 このような場合は、99%以上の変異率と計算していいのでしょうか？

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