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P値(統計解析)の記載方法 トピック削除
No.3747-TOPIC - 2015/01/14 (水) 21:28:29 - cyc
フローサイトメトリーを使用した実験の結果を論文にまとめています。
その実験は３回行ったのですが、ヒストグラムは代表の１回をのせようと思っています。
しかし、もちろん統計処理は３回の実験のデータを使うので、ヒストグラムの図にどのようにのせようか迷っています。
代表の１回の図にP値をのせてよいのか。
それとも、P値はすべての実験のデータから出したものなので、図（ヒストグラム）には付けず、図の説明のところに記載だけするべきか。
みなさんはどうされていますか？


また、すべての実験は、コントロール２つとサンプル２つを使用して、ある刺激を加えた前と後の違いを観察しています。
統計処理をした２つの実験の内、フローサイトメトリーの実験はコントロールとサンプルそれぞれ２つずつのデータすべてを使用して統計解析したのですが
（例.　コントロール１(刺激前)：11、13、コントロール２：13、12　
と
コントロール１(刺激後)：21、19、コントロール２：25、24　
でt-test（n=4）
サンプルも同様）
別の実験では、コントロール１の刺激前と刺激後でt-test(ボンフェローニ補正)、コントロール２の刺激前と刺激後でt-test(ボンフェローニ補正)、、、というように、コントロールとサンプルで２つずつ区別して解析しました。
１つの論文にまとめる時、このように実験によって統計解析の仕方が違うのは指摘されるでしょうか？
　
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(無題) 削除/引用
No.3747-5 - 2015/01/16 (金) 00:11:22 - おお
>[Re:4] sevenさんは書きました :
> 誤読しているかもしれないですが、n=4というのはbiological replicateで間違いないですよね。
> biological replicate　2　かつ　それぞれ2つのtechnical replicateの場合だとn=2で扱われると思いますが。
>

I agree.

(無題) 削除/引用
No.3747-4 - 2015/01/15 (木) 16:00:39 - seven
誤読しているかもしれないですが、n=4というのはbiological replicateで間違いないですよね。
biological replicate　2　かつ　それぞれ2つのtechnical replicateの場合だとn=2で扱われると思いますが。

(無題) 削除/引用
No.3747-3 - 2015/01/15 (木) 06:38:59 - cyb
> 代表の１回の図にP値をのせてよいのか。
> それとも、P値はすべての実験のデータから出したものなので、図（ヒストグラム）には付けず、図の説明のところに記載だけするべきか。
> みなさんはどうされていますか？

両方のパターンの図を作ってみて、見やすいほうでいいのではないでしょうか。ヒストグラムのサイトメトリーの図で中にP値があるのはあまり見ないかな・・・でもあっても大丈夫だと思いますよ。


> 別の実験では、コントロール１の刺激前と刺激後でt-test(ボンフェローニ補正)、コントロール２の刺激前と刺激後でt-test(ボンフェローニ補正)、、、というように、コントロールとサンプルで２つずつ区別して解析しました。
> １つの論文にまとめる時、このように実験によって統計解析の仕方が違うのは指摘されるでしょうか？

指摘されたら「自分はこういう理由でそれぞれの解析をした」と説明できればいいのではないでしょうか。

時期的に卒論をまとめてるのですかね。頑張ってくださいね。

(無題) 削除/引用
No.3747-2 - 2015/01/15 (木) 03:28:54 - おお
I'll pass this time.

P値(統計解析)の記載方法 削除/引用
No.3747-1 - 2015/01/14 (水) 21:28:29 - cyc
フローサイトメトリーを使用した実験の結果を論文にまとめています。
その実験は３回行ったのですが、ヒストグラムは代表の１回をのせようと思っています。
しかし、もちろん統計処理は３回の実験のデータを使うので、ヒストグラムの図にどのようにのせようか迷っています。
代表の１回の図にP値をのせてよいのか。
それとも、P値はすべての実験のデータから出したものなので、図（ヒストグラム）には付けず、図の説明のところに記載だけするべきか。
みなさんはどうされていますか？


また、すべての実験は、コントロール２つとサンプル２つを使用して、ある刺激を加えた前と後の違いを観察しています。
統計処理をした２つの実験の内、フローサイトメトリーの実験はコントロールとサンプルそれぞれ２つずつのデータすべてを使用して統計解析したのですが
（例.　コントロール１(刺激前)：11、13、コントロール２：13、12　
と
コントロール１(刺激後)：21、19、コントロール２：25、24　
でt-test（n=4）
サンプルも同様）
別の実験では、コントロール１の刺激前と刺激後でt-test(ボンフェローニ補正)、コントロール２の刺激前と刺激後でt-test(ボンフェローニ補正)、、、というように、コントロールとサンプルで２つずつ区別して解析しました。
１つの論文にまとめる時、このように実験によって統計解析の仕方が違うのは指摘されるでしょうか？
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