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(無題) 削除/引用 No.4672-4 - 2015/12/24 (木) 14:06:00 - イオーシェ KKI様 投稿ありがとうございます。 やはりrs1800592とA-3826Gは同一のSNPなんですね。 ありがとうございます。 数字が異なる部分に関してはやはり難しいのですね。 わかりました。引き続き調べてみます。 ありがとうございました。

(無題) 削除/引用 No.4672-3 - 2015/12/21 (月) 06:07:00 - KKI すいませんコピペ間違えました UCP1 Chromosome: 4:140559394..140568902, complement　(NC_000004.12)

(無題) 削除/引用 No.4672-2 - 2015/12/21 (月) 06:05:39 - KKI 見てみましたが、UCP1遺伝子の3905塩基上流で間違いないかと思います。 rs1800592[Homo sapiens] ATTTCTGATTGACCACAGTTTGATC[A/G]AGTGCATTTGTTAATGTGTTCTACA Chromosome: 4:140572807 UCP1 Chromosome: 4:141481014..141489989, complement (NC_000004.11) 数字がなぜ違うかはわかりませんが、おそらく同じものです。  Correlation of the -3826A >G polymorphism in the promoter of the uncoupling protein 1 gene with obesity and metabolic disorders in obese families from southern Poland.   2002年にあったこの論文にどうやってgenotypingしたか書いてありました。   

SNP及び塩基置換の表記法について 削除/引用 No.4672-1 - 2015/12/17 (木) 10:14:32 - イオーシェ トピックの通り塩基置換の表記方法について質問させてください。 SNPの実験を検討中ですが、塩基置換の位置をNCBIのSNPの位置で確認していますが確認できません。 今検討中のSNPはUCP1遺伝子に関連する塩基置換である「A-3826G」（もしくは「-3826A/G」）です。これはrs1800592だと論文で記述があったのですが、NCBIで確認したら「A-3826G」と位置関係が確認できませんでした。 そこで、「A-3826G」の-3826はどこから数えるのか？（UCP1遺伝子の頭から？） そもそも「A-3826G」とrs1800592は同一なのか？ わかる方がいましたらご教示ください。よろしくお願い致します。

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