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(無題) 削除/引用 No.4700-8 - 2015/12/28 (月) 07:33:25 - mon 二次構造予測サイトは管理人さんの別ページにありますよ。 www.kenkyuu.net/genetool-05.html 複数プログラムを使って比較してください。 ただし、抗体の出来やすいところは切断する予定のフレキシブルな領域だったするので、alpha-helixとかbeta-sheet構造の終わり辺りを選択するが良いと思います。 切断点のアミノ酸としては、Glyの前、Serの前、Proの後ろが目安かな。次点でAlaかな。 これらアミノ酸が連続していると高次構造を取りづらい（破壊する）ので。

(無題) 削除/引用 No.4700-7 - 2015/12/27 (日) 17:17:38 - おお alpha-helixとbeta-sheetのよそくはペプチド抗体のエピトープ予測ソフトなどでもできるので一度そういうソフトにかけてみてもいいかもしれません。でなるだけ多くのエピトープをカバーするような領域のリコンビナントを作るのもてかと。あとはパラログであまりにも配列が似ている部分は避けてもいいかもしれません。また一度スプライシングや転写開始位置の違いによるアイソフォームも確認しておくといいでしょう。

(無題) 削除/引用 No.4700-6 - 2015/12/27 (日) 11:34:25 - なり みなさんコメントありがとうございます。 訳あって、ペプチドではなく、リコンビナント抗原を使う必要があります。 >monさま、 alpha-helixとbeta-sheet構造をアミノ酸配列から予想するwebsiteはありますでしょうか？

(無題) 削除/引用 No.4700-5 - 2015/12/27 (日) 11:16:54 - あ ペプチド交代に1票

(無題) 削除/引用 No.4700-4 - 2015/12/26 (土) 22:28:04 - ano ペプチド抗体に交代

(無題) 削除/引用 No.4700-3 - 2015/12/26 (土) 19:01:53 - mon コドン最適化、あるいは、rare codonを置換する

(無題) 削除/引用 No.4700-2 - 2015/12/26 (土) 19:00:38 - mon N-end rule alpha-helixとかbeta-sheet構造を分断しない

リコンビナントタンパク質の作成デザイン 削除/引用 No.4700-1 - 2015/12/26 (土) 18:21:08 - なり 大腸菌でリコンビナントタンパク質を作成しようとしています。リコンビナントタンパク質は抗体作出のための抗原として使用するつもりです。 抗原には全長のタンパク質は必要ないので、アミノ酸配列から親水性の高い一部の領域(180 aa程度）を選択し、pET系のHisTagタンパク質として精製しようと思っています。その一部の領域の選択方法として、考慮すべき点を教えてもらえませんか？ここでは、訳あって意図的にインクルージョンボディに発現させることはしたくありません。 誘導時や精製時に分解されにくいようなアミノ酸領域を選択するにはどのようにすればよいでしょうか？ なんでも構いませんので、コメントいただけると、幸いです。

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