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Glaxyを用いたRNAseq:tophatがうまくいきません。 削除/引用 No.5649-3 - 2017/01/02 (月) 16:41:21 - かい 早速ありがとうございます。心強いです。 今から試してみます。状況はまたアップします。

(無題) 削除/引用 No.5649-2 - 2017/01/02 (月) 16:31:51 - seohajime FASTQファイルにTophatを実行することでしょうか？ Tophatを実行する前に、そのファイルのpencilアイコン押し、Edit Attributes を選択、Auto-detectを押したら、どうでしょうか。

Glaxyを用いたRNAseq:tophatがうまくいきません。 削除/引用 No.5649-1 - 2017/01/02 (月) 15:43:52 - かい RNAseq解析に詳しい方ご教授ください。 現在イルミナNGSから出てきたペアエンドリードのｄａｔａを用いてGlaxyにてRNAseqをおこなっています。 最終的には、コントロールと実験群の遺伝子発現量の差を出したいと思っていますが、TopHatにて An error occurred setting the metadata for this dataset Set it manually or retry auto-detection 87 TopHat on data 12 and data 11: accepted_hits というエラーがいつも出てしまい。うまくいきません。 どなたか解決方法を知っていないでしょうか？

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