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(無題) 削除/引用 No.6311-2 - 2017/09/14 (木) 08:48:11 - X サンガーで検出できないという事は、全ゲノム増幅に伴うエラーという判断になるように思いますが、、、 サンガー用のPCRは、全ゲノム増幅なしで行ったのですよね？

全ゲノム増幅後の配列 削除/引用 No.6311-1 - 2017/09/13 (水) 17:08:52 - かき氷 ある微小サンプル（腫瘍ではなくその個体の正常組織です）からゲノムを抽出し、全ゲノム増幅をかけた後に、全ゲノム解析を行ったところ、 ある遺伝子に4bpのinsertionを認めました。 このinsertionは、raw dataではかなりのcoverageで読まれているのですが、 なぜかPCRとサンガー法の組み合わせで解析するとこの変異が見つかりません。 逆に、raw dataにはinsertionのない配列はまったく存在していない状況です。 そして、他の遺伝子にはこういった不可解なinsertionはまったく見つかりません。 微小といっても、single cellのオーダーではなく、計測可能な量を増幅したのですが、やはり全ゲノム増幅に伴うエラーと考えるのが妥当なのでしょうか？

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