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The Human Protein Atlas トピック削除
No.1008-TOPIC - 2012/10/11 (木) 09:46:38 - おお
http://www.proteinatlas.org/
みなさんはどのように利用しているでしょうか?
 
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(無題) 削除/引用
No.1008-10 - 2012/10/11 (木) 21:03:50 - 直輝
非特異的に染まりやすい組織・部位もあるはずですよね。
(私はそういう感覚に疎いのですが)


>WBもやっているようですがイメージはないですよね
ポジコン組織とネガコン組織でやってるぐらいで、組織横断的にはWBしてないみたいですねー

(無題) 削除/引用
No.1008-9 - 2012/10/11 (木) 20:37:51 - 直輝
私も皆様にお尋ねしたいのですが、Antibody validationの項目はどれくらいアテになる印象ですか?

Supportiveと書かれていると信用したくなってしまいますが、(自分の中で)決め手に欠けるんですよね…

(無題) 削除/引用
No.1008-7 - 2012/10/11 (木) 14:35:42 - qq
human protein atlasは、atlas antibodiesのHPだと思った方がよろしいです。ここの抗体を蛍光の結果を見て、1つ買いましたが、高かったこと以外に問題を感じませんでした。よかったな、と言う感じです。染色や蛍光のデータを信じる必要はありませんが、参考データ程度には、使えるかなと思います。
INFOのantibody/antigenのところは、それなりに誠実かなと思います。
まあ、買った抗体は1つだけですから、その程度の感想です。

(無題) 削除/引用
No.1008-6 - 2012/10/11 (木) 14:06:43 - おお
たしかにデーターベースってそんなもんですね。

(無題) 削除/引用
No.1008-5 - 2012/10/11 (木) 13:58:04 - み
>[Re:4] おおさんは書きました :
> なにか細かい事情をご存じなんでしょうか。WBもやっているようですがイメージはないですよね。。。複数の抗体でやっているようなので、それらで一致してたら信じそうです。。。
>

自身が扱っている遺伝子に関してのみ言うと、抗体染色データは嘘っぱちです。たとえsigm?で販売されている抗体を使っていたとしてもです。
humanアトラスのみならず、他のデータベースに関しても同様に思います。
アレイによるハイブリの値は複数のアレイデータを比較するとバラバラだったり。
q-PCRの相対値は高発現部位は信じて良いかもしれない程度の印象。

(無題) 削除/引用
No.1008-4 - 2012/10/11 (木) 13:38:43 - おお
>[Re:3] みさんは書きました :
> mRNAレベルは参考程度。
>
> 抗体染色による蛋白発現は信じない。
そうすっか。。。
なにか細かい事情をご存じなんでしょうか。WBもやっているようですがイメージはないですよね。。。複数の抗体でやっているようなので、それらで一致してたら信じそうです。。。

(無題) 削除/引用
No.1008-3 - 2012/10/11 (木) 12:48:00 - み
mRNAレベルは参考程度。

抗体染色による蛋白発現は信じない。

(無題) 削除/引用
No.1008-2 - 2012/10/11 (木) 10:49:00 - おお
&どの様に使おうと思いますか?

The Human Protein Atlas 削除/引用
No.1008-1 - 2012/10/11 (木) 09:46:38 - おお
http://www.proteinatlas.org/
みなさんはどのように利用しているでしょうか?

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