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(無題) 削除/引用 No.102-8 - 2012/02/01 (水) 17:04:50 - G ありがとうございます。 検討をしてみます。

Nugen HP 削除/引用 No.102-7 - 2012/02/01 (水) 15:50:55 - ema おそらくWT-OVATION™ FFPE SYSTEMを利用することとなります。 日本だとMedbicが今輸入代理店で、NugenのHPからダウンロードできるファイルがありまして、Affymetrixとかの対応条件、むこうが確認した実験データすべてあります。 http://www.medibic.com/product/nugen.html http://www.nugeninc.com/nugen/index.cfm/applications/rna/rna-micro/

(無題) 削除/引用 No.102-6 - 2012/02/01 (水) 15:24:00 - G 参考になる情報をありがとうございます。 もし宜しければ、お薦めのOvation Systemを教えていただけますと 大変助かります。

分解RNA 削除/引用 No.102-5 - 2012/02/01 (水) 13:32:06 - ema FFPE由来RNAサンプルは回収しても非常に分解しているので、OvationSystemでの標識をお勧めします。（現在非公式でAffymetrixもAgilentも認めています）おそらく通常のAmbion WT Expression KitではT7 Primerでの増幅ができない遺伝子が大半だと思います。 シグナル的にはOvationSystemを使用した方が低く特徴的になるので、Ambion WT Expression Kitのデータと単純比較はしない方がよいです。 ただ、上がっている遺伝子下がっている遺伝子の方向性はあまり変わらないでの同じ標識条件では遺伝子抽出はできます。 が、OvationSystemで1.5倍あがっているのが、Ambion WT Expression Kitでは5倍あがっているとかの状況は発生するので過去データとか品質の良いデータとの比較は止めてくださいね。

分解RNA 削除/引用 No.102-4 - 2012/02/01 (水) 13:25:55 - ema FFPE由来RNAサンプル

(無題) 削除/引用 No.102-3 - 2012/02/01 (水) 09:00:40 - G これから使ってみたいと考えています。 何か、情報がございましたら、宜しくお願いいたします。

(無題) 削除/引用 No.102-2 - 2012/02/01 (水) 08:31:41 - Harmonia これから使いたいのか、 使って失敗したのか。 後者なら、どうやって、どんな結果が得られたか。

Ambion Wt Expression Kitを使いFFPE由来サンプルを増幅 削除/引用 No.102-1 - 2012/01/31 (火) 20:17:05 - G FFPE由来RNAサンプルを、Ambion WT Expression Kitで増幅し、その後、Affymetrix社のGeneArray解析をされたことはありますか。 もし、ある場合、RNAの持ち込み量は、どのくらいでしょうか。 また、増幅したcDNA量はどうでしたでしょうか。 GeneArrayの解析結果もあれば、教えていただけるとありがたいです。

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