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(無題) 削除/引用 No.10460-4 - 2022/05/24 (火) 18:44:47 - 　m、；： KD/KOされて当該タンパク質が（遺伝子発現レベルでなくタンパク質レベルで）十分に減少していることは確認されていますか。導入してからだいたい何時間くらいですか。当該タンパク質がなくなることによって起こるであろう事象は、導入した時点からでなく、タンパク質量が底をついた時点から始まると思うのです。タンパク質の半減期は個々のタンパク質ごとに非常に幅があり様々ですし。 一つ一つ確認しつつ段階踏んで進めたほうがいいと思います。

(無題) 削除/引用 No.10460-3 - 2022/05/24 (火) 03:29:48 - おお epigenetic と言われても、今は様々なものが示されていて私も今は把握しきれていません。epigenetic な制御は細胞分裂を経ても維持されるものとして古典的なものではメチレーションが Replication のときに維持されるメカニズム、修飾されたヒストンなどが分裂時に維持されるメカニズムなども示されています。逆に言うと、そういうメカニズムを遮断することになるのなら分裂したあとの方がいいことになります、あなたがターゲットにしているepigenetic な機構がどれに当たるか知りませんが、いちどレビューなどを調べてみることをおすすめします。コンセプトから考えてepigeneticな制御は細胞分裂後も維持されるものと思っていますが、冒頭でも申し上げましたようにいろいろな事がepigeneticとして示されている現状もありますので、、、 また２４時間を超えると分裂するとおっしゃいますが、細胞分裂の周期が揃ってないことを考えると２４時間がDoubling timeとしてかなり大雑把な推測をすると１２時間で半分の細胞は分裂してしまっているとも言えますが、、、

(無題) 削除/引用 No.10460-2 - 2022/05/23 (月) 22:15:15 - ｗ KDしたい因子がなくなる（分解される）までにもう少し時間がかかるのでは

エピジェネティックな変化が起こるのに必要な時間 削除/引用 No.10460-1 - 2022/05/14 (土) 22:47:05 - OOT とあるcancer cell lineを用いて、あるepigenetic regulator遺伝子のKD/KO実験を行っています。 KD/KOを導入してから、24時間後の細胞を回収して、gene expressionを調べたのですが、ほぼほぼ変化がありません。一般論として、epigeneticな変化が起こる(ゲノムの変化やトランスクリプトムの変化)には、どれくらいの時間が必要なのでしょうか。 24時間を超えると細胞分裂も起こると思うで、様々なファクターも関わってくると思うのですが、細胞分裂を経た場合と経ない場合で、epigeneticな変化への影響があるのかも気になります。どなたかアドバイスをいただけないでしょうか。 screening で見つけてきた遺伝子のため、エピジェネティックを扱うのは初めてです。

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