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FISH プローブはプライマーの要領でオーダーできるか? トピック削除
No.10501-TOPIC - 2022/05/29 (日) 00:40:31 - 444
バクテリアの検出のために、FISHを予定しています。

RNAプローブの配列は確定していて、既製品もあります。

その一方で、プライマーを依頼している会社と同じ核酸合成会社で、合成依頼しても同じものができるのでしょうか?

既製品として、市販されているものもあるのですが、異常に高く、既製品と自分で合成依頼をした商品がほぼほぼ同じなのか、よく分からずここで質問させていただきます。
 
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(無題) 削除/引用
No.10501-3 - 2022/05/30 (月) 13:31:13 - AA
修飾ヌクレオチド鎖の人工合成はサービスごとにどんな修飾ができるか違いもあると思いますのでよく確認されるとよいかと思います。
同じFISHでも、末端部位への蛍光標識とジゴキシゲニン標識UTP取り込みによる標識ではだいぶ差が出ると思います。

配列が既知、とのことですのでシンプルなプローブだと思いますが、最近市販されているものにはRNA scopeのような増幅テクニックが用いられているものも多く、自分の手元で再現するのが大変なケースも珍しくないと思います。

また、人工合成で手元に届く収量と、自分でIVTして得られる収量で結構差が出るんじゃないかと思いますのでその辺はコスト計算を気をつけられたほうがよろしいかと思います

(無題) 削除/引用
No.10501-2 - 2022/05/29 (日) 10:07:16 - おお
基本一緒の配列のRNAが来るわけですから、、、精製度、ラベルの仕方、効率が一緒であれば、まあ一緒のものが手に入るともいますが、書かれているだけのことからすべてを見極めるのはちょっと難しいです。

FISH プローブはプライマーの要領でオーダーできるか? 削除/引用
No.10501-1 - 2022/05/29 (日) 00:40:31 - 444
バクテリアの検出のために、FISHを予定しています。

RNAプローブの配列は確定していて、既製品もあります。

その一方で、プライマーを依頼している会社と同じ核酸合成会社で、合成依頼しても同じものができるのでしょうか?

既製品として、市販されているものもあるのですが、異常に高く、既製品と自分で合成依頼をした商品がほぼほぼ同じなのか、よく分からずここで質問させていただきます。

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