BioTechnicalフォーラム [可溶性タンパク質について]

可溶性タンパク質について

No.106-TOPIC - 2012/02/02 (木) 01:07:56 - 無知の知

現在性状解析しているタンパク質はアミノ酸配列から可溶性であることが分かっています。
また、このタンパク質の組換えタンパク質を作成した際の解析でも可溶性のタンパク質であることが分かっています。
しかし、細胞を分画したとき、脂質ラプトの分画にシグナルが検出されました。(サンプルには2-MEを加えていますので、S-S結合は切断されていると思います。)
可溶性のタンパク質で細胞膜にかっちりアンカーされているものって、あるんでしょうか？
　

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No.106-5 - 2012/02/02 (木) 11:56:39 - お粗末君

>細胞を分画したとき、脂質ラプトの分画にシグナルが検出されました。(サンプルには2-MEを加えていますので、S-S結合は切断されていると思います。)

S-Sを切ってる時点でラフト画分に来ている事と膜結合には何の関係も示せないと思います。
ラフト画分自体、細胞膜との直接の関係性は有りません。
膜のラフトとラフト画分と呼ばれているものはイコールではありません。
ラフト画分は脂質と団子になってるというだけです。
細胞膜にアンカーされているのではないかと推測するデータにしかなりません。

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No.106-4 - 2012/02/02 (木) 10:33:01 - み

脂質に埋め込まれなくても膜貫通蛋白に細胞質側から結合する蛋白なら、ラフトや小胞膜画分に行っても不思議ではないのいでは？
この辺の相互作用の保持はバッファー組成にもよるでしょうが。

染色でも局在を調べた方が良いでしょう。

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No.106-3 - 2012/02/02 (木) 09:14:18 - AP

ミリストイル化、パルミトイル化などの脂質修飾の可能性はみてみましたか（一次配列からある程度予測可能）。

PHドメイン、両親媒性ヘリックスなどの脂質親和性のドメインはないですか。
脂質に対してでなく、別の膜タンパク質に対して親和性があるとか。

(無題)

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No.106-2 - 2012/02/02 (木) 07:06:56 - ga

ありますよ。