Bio Technical フォーラム

  • バイオ関連の実験をする上での、試薬、機器、プロトコールなどの情報交換の場です。
  • 新しいテーマで話を始める場合、質問をする場合は「新しいトピックを作る」から書き込みをしてください。
  • 質問に対して解答できる方は是非、書き込んで下さい。
  • このフォーラムにふさわしくないと管理人が判断した投稿は予告なく削除します。

新しいトピックを作る | トピック一覧 | 研究留学ネットに戻る

ひとつ前のフォーラム(readのみ)

このスレッドをはてなブックマークに追加このスレッドをはてなブックマークに追加

FASTQファイル トピック削除
No.10979-TOPIC - 2022/11/23 (水) 13:36:11 - ss
RNA-seqデータ解析についてです。
FASTQデータを開くためのおすすめのソフトには
どのようなものがありますか?
 
- このトピックにメッセージを投稿する -



4件 ( 1 〜 4 )  前 | 次  1/ 1. /1


(無題) 削除/引用
No.10979-4 - 2022/11/26 (土) 16:37:58 - ss
有益な情報ありがとうございました。
参考にさせていただきます。

(無題) 削除/引用
No.10979-3 - 2022/11/24 (木) 17:20:22 - G25
塩基配列も品質スコアもテキストとして開くだけなら、text editorならなんでもいい。ただし、巨大なmultiple Fastqファイルなんかを開くなら、大きなサイズのファイルを扱うのに優れたソフトを選んだほうがいい。Windowsのワードパッドやメモ帳は扱うことのできるファイルサイズが小さい。

塩基配列だけ抜き出して、各塩基ごとに品質スコアをヒストグラムで並列表示するのには、私はSnapGene Viewer (SnapGeneの無料版)を使っています。multiple Fastqも読み込んで、個々のエントリーごとに切り分けてくれます。

(無題) 削除/引用
No.10979-2 - 2022/11/23 (水) 15:48:50 - toto
ubuntuだとtext editor、Windowsだとメモ帳。

FASTQファイル 削除/引用
No.10979-1 - 2022/11/23 (水) 13:36:11 - ss
RNA-seqデータ解析についてです。
FASTQデータを開くためのおすすめのソフトには
どのようなものがありますか?

4件 ( 1 〜 4 )  前 | 次  1/ 1. /1


パスワードを入力してチェックした記事を チェックした記事を

このトピックにメッセージを投稿する
名前 
メール   アドレス非公開
   タイトル 
本文      
設定  クッキーを保存(次回の入力の手間を省けます)
上に上げない(トピックの一覧で一番上に移動させません)
解決(問題が解決した際にチェックしてください)
暗証  半角英数字8-12文字の暗証番号を入れると、あとで削除、修正ができます。
送信 

〔使い方〕
  • 「アドレス非公開」をチェックすれば、自分のメールアドレスを公開しないで他の方からメールを受け取れます。
  • 問題が解決した際には、解決ボタンをチェックして解決した旨のコメントをつけてください。これは、初めにトピックを作った人と管理人のみが可能です。
  • 半角カタカナ、機種依存文字(全角ローマ数字、○の中の数字等)は文字化けの原因となりますので使わないでください。