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(無題) 削除/引用 No.11021-4 - 2022/12/09 (金) 12:46:30 - おお Intron-containing pre-tRNAs are found in a variety of organisms from all three domains of life. In lower eukaryotes, approximately 25% of all tRNA genes contain introns (Trotta et al. 1997), whereas, in humans, only 6% of tRNA genes contain introns (Lowe and Eddy 1997). https://www.cell.com/cell/fulltext/S0092-8674(04)00342-3?_returnURL=https%3A%2F%2Flinkinghub.elsevier.com%2Fretrieve%2Fpii%2FS0092867404003423%3Fshowall%3Dtrue 言いたいことは、成熟型とイントロンを含む物を両方増やせるようにすると、成熟型のシグナルが強すぎてイントロンを含む未成熟型が検出される状況でははっきりとバンドが見れても、成熟型のシグナルはすでに飽和してしまっているのでイントロンがあるものがどれぐらいの割合か示せないし、例えイントロンがあるバンドが2倍ぐらいになってたとしても、成熟型の量を信用性のあるで示せないなら説得力がないと言うこと。

(無題) 削除/引用 No.11021-3 - 2022/12/09 (金) 02:39:44 - iid すいません。その文献おしえていただけないですか。 ただ、結合タンパク質がイントロンに関わる遺伝子群ですので、例え全てを制御していなくても、その6%解析できれば十分かもしれません。

(無題) 削除/引用 No.11021-2 - 2022/12/09 (金) 00:02:19 - おお ちょっと見てみると、ヒトのtRNAは94%が成熟型で、6%ぐらいしかイントロンの入ったものが見つからないらしい。両者のバンドを定量的に比較するのは難しいのではないか。 一方をイントロンに、他方を成熟型にある配列でプライマーを設定してqPCRした方がわかりやすいような気がする。

tRNAの確認方法 削除/引用 No.11021-1 - 2022/12/08 (木) 12:02:27 - iid ある遺伝子を解析していたら、tRNAの生合成に関わる遺伝子にがっつりと結合することが分かりました。 次のstepとして、tRNAがmatureなのかimmatureなのかを知りたいのですが、できるだけ簡単な方法の方が結果がクリアーな結果が得られると思いますので、RT-PCRでintronが取り除かれているのか否かを調べたいと考えています。 ヒト以外の生物種では、RT-PCRの長さ、つまりイントロンが挿入されているか除かれているか、でmatureとimmatureなのかを判断しているのですが、何故かヒトではそういった論文がありません。 何かうまくいかない理由があるのでしょうか。かなり各論的な内容なので、返信があるといいのですが、、、、

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