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ジェノタイピングの結果の味方 トピック削除
No.11313-TOPIC - 2023/03/29 (水) 05:53:59 - wsd
共同研究先からジェノタイピングの結果が送られてきました。
こちらが色々知っている前提で結果が送られてくることが多々あります(こちら弱小ラボです泣)。

恐らく皆様には簡単な質問なのですが、
1) 以下2つの違いを教えていただけないでしょうか?

1 G/G 2G/G
2 G/G 2G/G

2) また、2 G/G 1G/Gや1 G/G 1G/Gというものは存在しないのでしょうか?
 
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(無題) 削除/引用
No.11313-9 - 2023/03/30 (木) 12:57:49 - asan

>こちらは弱小ですので、機嫌を損なわないように、なるべく自分達で処理しないといけない立場です。

そんなことはないと思いますが。

そもそもある程度大きな研究室ならば、大枠でのコラボはPI同士で連絡するでしょうが実際に資料の送付等についてはそのラボメンバーが対応すると思います。あなたがPIだろうが大学院生だろうが結局は勝手に忖度してその直接やりとりする人に聞くことがなぜそんなに難しいものなのか不明です。

わからないから教えてください、っていうといい顔しないかもしれませんが、「不勉強ですみませんがG/Gという表記は遺伝的多型のxx遺伝子の各アリルのXXとAAという多型のジェノタイプを表してるという認識で大丈夫でしょうか?」という質問を、サンプルのやりとりの中で受け取り確認の連絡家庭でするのに当たって、機嫌を損ねるという状況は自分にとっては不明です。

(無題) 削除/引用
No.11313-8 - 2023/03/30 (木) 02:21:50 - おお
学税->学生

(無題) 削除/引用
No.11313-7 - 2023/03/30 (木) 02:20:26 - おお
1 G/G 2G/G
2 G/G 2G/G

最初の1と2はサンプルが2つあるということかと思いました。あるいは2回タイピングをして再現性あると言いたいのか。実際何を見てもらったかはこちらでは判断できませんのでそうでないかもしれないけど知る余地もありませんので。

G/G 2G/G
については2箇所見ていて一方のじぇのタイプがG/G、もう一つが2G/Gということのように思いました。ジェノタイプを見てもらってそれがどこかわからないってことはないと思うのですが、、、一か所と思っていたら2箇所あったとしても対象の遺伝子がわかっていれば察しが付くだろうからそのうえで共同研究先に相談するといいかもしれません。

2G/Gについては該当箇所にGGとGが2つ並んでいるのか、Gが一つなのかで2GとGの表記を当てていると思えます(前のリファレンスのように)。

asanさんのリファレンスをみるとGを1Gと表記することもあるようですね。

まあ向こうもいきなり「これなんですかぁ」と聞かれるとびっくりだと思うのでそういうところをあたりをつけて、「こういうことですかねぇ」といった風に聞いたほうがいいでしょうけど、それもできないのならばあなたの研究にたいする技量をちょっと疑いたくなります(言い過ぎかもしれませんけど)。

また、共同研究先も実際手足を動かしている人、学税などいるでしょうからちょっとしたテクニカルな質問とかどなたかそういう人を紹介してもらってそこで細かい質問をするということも向こうが容認するならできるはず。

>2 G/G 1G/Gや1 G/G 1G/G
それは対象箇所のSNIPSのバリエーションがどのようになっているか調べれば察しが付くのではないでしょうか?

(無題) 削除/引用
No.11313-6 - 2023/03/30 (木) 01:39:41 - wsd
別の件でも、何度か質問のやり取りはしていますが、実力差(あるいは親切心)などがあり、基本的にかみ合いません。
こちらは弱小ですので、機嫌を損なわないように、なるべく自分達で処理しないといけない立場です。(研究に限らず私生活でもよくある話かと思います。ですので、良くみるタイプの質問です)

(無題) 削除/引用
No.11313-5 - 2023/03/30 (木) 00:47:50 - LPS
なんで共同研究者に聞かないのか、超不思議。
時々、そう思う質問があります。
不確かな情報より、結果を出した本人に聞くほうが良いと思うんですけど。

(無題) 削除/引用
No.11313-4 - 2023/03/29 (水) 22:57:13 - wsd
つまり、ヘテロorホモを示しているということでしょうか?

(無題) 削除/引用
No.11313-3 - 2023/03/29 (水) 19:02:46 - asan

一般的なジェノタイプというよりも、遺伝子多型の表記じゃないですかね?
それぞれの多型を含む遺伝子の特徴を個別にそう表記してるだけかもしれません。

https://patents.google.com/patent/JP2003235576A/ja

https://www.jstage.jst.go.jp/article/jsmtmr/19/0/19_0_28/_pdf/-char/ja

(無題) 削除/引用
No.11313-2 - 2023/03/29 (水) 06:04:43 - おお
PMC6506809
PMID: 12499258

こんなやつですかね。2箇所のジェノタイピングを調べてもらったのでは?

ジェノタイピングの結果の味方 削除/引用
No.11313-1 - 2023/03/29 (水) 05:53:59 - wsd
共同研究先からジェノタイピングの結果が送られてきました。
こちらが色々知っている前提で結果が送られてくることが多々あります(こちら弱小ラボです泣)。

恐らく皆様には簡単な質問なのですが、
1) 以下2つの違いを教えていただけないでしょうか?

1 G/G 2G/G
2 G/G 2G/G

2) また、2 G/G 1G/Gや1 G/G 1G/Gというものは存在しないのでしょうか?

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