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遺伝子発現を比較するときのreference(分母)を変えたい トピック削除
No.11695-TOPIC - 2023/08/08 (火) 11:55:59 - birds
edgeRでA群とB群を比較した結果、FoldChangeがA/Bで出てきます。これをB/Aで出力させたいのですが、方法をご存知の方がいらっしゃいましたら、教えていただけますと助かります。

(DEseq2ではアルファベット順に応じて分母をどちらにするかを決めるとのことでしたが、edgeRではアルファベット表記を変えても分母が入れ替わりませんでした)
 
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遺伝子発現を比較するときのreference(分母)を変えたい 削除/引用
No.11695-1 - 2023/08/08 (火) 11:55:59 - birds
edgeRでA群とB群を比較した結果、FoldChangeがA/Bで出てきます。これをB/Aで出力させたいのですが、方法をご存知の方がいらっしゃいましたら、教えていただけますと助かります。

(DEseq2ではアルファベット順に応じて分母をどちらにするかを決めるとのことでしたが、edgeRではアルファベット表記を変えても分母が入れ替わりませんでした)

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