Bio Technical フォーラム

  • バイオ関連の実験をする上での、試薬、機器、プロトコールなどの情報交換の場です。
  • 新しいテーマで話を始める場合、質問をする場合は「新しいトピックを作る」から書き込みをしてください。
  • 質問に対して解答できる方は是非、書き込んで下さい。
  • このフォーラムにふさわしくないと管理人が判断した投稿は予告なく削除します。

新しいトピックを作る　|　トピック一覧　|　研究留学ネットに戻る

ひとつ前のフォーラム（readのみ）

このスレッドをはてなブックマークに追加このスレッドをはてなブックマークに追加

微量RNA-Seqの外注先（cDNAサンプル） トピック削除
No.11727-TOPIC - 2023/08/22 (火) 00:40:40 - もち
FACSで分取した微量細胞（10~100cells程度）からtakara社のsmart-seq v4 Ultra Low Input RNA kit で合成したcDNAを提出サンプルとして発現解析をしたいと検討しております．

目的は分取した細胞種の転写産物の中に特定の代謝経路に関連する遺伝子群があるかを探すことです．非モデル生物ですが，リファレンス配列は整備されています．

そこでNGS（できれば発現解析もやってほしい）の外注先を探していますが，検体数が少なく，このような特殊なサンプルでも受け入れてもらえるところを知っている方がいれば教えてください．

当方は普通のRNA-Seqの発現解析（トリミング，マッピング，カウントなど）は経験がありますが，あまりDRY解析に強くありませんので，納品が通常のRNA-Seqと違っていると解析等が困難になってきます．

ご教授お願いします
　
- このトピックにメッセージを投稿する -



全1件 ( 1 〜 1 )　 前 | 次 　1/ 1. /1

微量RNA-Seqの外注先（cDNAサンプル） 削除/引用
No.11727-1 - 2023/08/22 (火) 00:40:40 - もち
FACSで分取した微量細胞（10~100cells程度）からtakara社のsmart-seq v4 Ultra Low Input RNA kit で合成したcDNAを提出サンプルとして発現解析をしたいと検討しております．

目的は分取した細胞種の転写産物の中に特定の代謝経路に関連する遺伝子群があるかを探すことです．非モデル生物ですが，リファレンス配列は整備されています．

そこでNGS（できれば発現解析もやってほしい）の外注先を探していますが，検体数が少なく，このような特殊なサンプルでも受け入れてもらえるところを知っている方がいれば教えてください．

当方は普通のRNA-Seqの発現解析（トリミング，マッピング，カウントなど）は経験がありますが，あまりDRY解析に強くありませんので，納品が通常のRNA-Seqと違っていると解析等が困難になってきます．

ご教授お願いします
全1件 ( 1 〜 1 )　 前 | 次 　1/ 1. /1

パスワードを入力してチェックした記事を チェックした記事を

このトピックにメッセージを投稿する
名前 
メール  　アドレス非公開
   タイトル 
本文      
設定  クッキーを保存（次回の入力の手間を省けます）
上に上げない（トピックの一覧で一番上に移動させません）
解決（問題が解決した際にチェックしてください）
暗証  半角英数字8-12文字の暗証番号を入れると、あとで削除、修正ができます。
送信 
〔使い方〕
  • 「アドレス非公開」をチェックすれば、自分のメールアドレスを公開しないで他の方からメールを受け取れます。
  • 問題が解決した際には、解決ボタンをチェックして解決した旨のコメントをつけてください。これは、初めにトピックを作った人と管理人のみが可能です。
  • 半角カタカナ、機種依存文字(全角ローマ数字、○の中の数字等)は文字化けの原因となりますので使わないでください。