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(無題) 削除/引用 No.11922-5 - 2023/11/17 (金) 04:36:13 - おお http://www.science.smith.edu/cmbs/wp-content/uploads/sites/36/2015/09/P-and-q-values-in-RNA-Seq.pdf 参考資料

(無題) 削除/引用 No.11922-4 - 2023/11/16 (木) 22:09:03 - SN 遺伝子Aの発現量についてコントロールと対照群の二つで比べているのであれば、P値はその二つの間の差が統計的に優位な差であるかどうかを示しています。 どのような検定を使われているのか分からないですが、二群間で比較する場合でも、数万もの遺伝子を網羅的に解析する際には偽陽性を抑えるため、Multiple t testsなどでp値を補正する必要があると思います（q値）。

(無題) 削除/引用 No.11922-3 - 2023/11/16 (木) 16:51:11 - あの A群と対照群の間でt 検定などの有意差検定をした際のP値でしょう。 x軸をlog2fold change、y軸をP値の対数(底は10)として、全ての遺伝子の散布図を描くと ボルケーノプロットになります。

(無題) 削除/引用 No.11922-2 - 2023/11/16 (木) 03:37:13 - おお たいてい解析する際にFDRで多重検定の補正がされていると思うけど。元データーのエクセルはP値、その補正値が併記されているのも多いと思いますが。 ＞P値は遺伝子Aに対して検定を行なっているのでしょうか？ そうだと思う（ふつうはそうだけど）のだが、質問の意味がつかみづらい。 お示しのことだけでは詳細がわからないので、解析した人とかそのデーターを受け取った人とか、解析経験がある人とか、あなたのデーターや見る内容を把握している（できそうな）人と相談してください

RNA-Seq 統計解析 削除/引用 No.11922-1 - 2023/11/16 (木) 03:24:47 - b4 大学4回生のものです。 RNA-Seqの遺伝子の発現量比較についての質問です。 私の研究室ではlog2 fold changeとP値を使って、発言が変動したかを確認しています。 そこで質問なのですが、log2はある遺伝子Aが、controlと比べて何倍発言しているかどうかを表しているかと思いますが、P値は遺伝子Aに対して検定を行なっているのでしょうか？ また、二群間で比較する場合もP値は補正する必要があるのでしょうか？

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