Bio Technical フォーラム

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微生物 トピック削除
No.11969-TOPIC - 2023/12/03 (日) 06:35:14 - あい
微生物による元素Xの新たな物質変換経路を発見しました。という課題で物質Xに硫黄を選びました。微生物で硫黄化合物の新たな物質変換経路で良さそうな案ないでしょうか?
宿題の期限が迫っているのですが1つもアイデアが出ずに困っています。
もしよければ一緒に考えていただきたいです。
 
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(無題) 削除/引用
No.11969-17 - 2023/12/04 (月) 11:45:29 - 横槍
ここって結構色んな所の先生が見てるからね。
課題を出した先生が見てないと良いね。

(無題) 削除/引用
No.11969-16 - 2023/12/03 (日) 15:25:06 - おお
>[Re:15] あいさんは書きました :
> けっこう自由度は大きい授業になっています
>
> 生体で使われる物質でその元素をSに置き換えた化合物が作られて、医療や研究試薬で使われているって具体的にどんなものがあったりしますか?
> ぜんぜん無知ですみません。

それぐらいは調べてくださいよ。。。
まあいいかぁ。

www.caymanchem.com/product/14957/adenosine-5%27-(γ-thio)-triphosphate-(lithium-salt)


www.genelink.com/oligo_modifications_reference/OMR_mod_category_intro.asp?mod_sp_cat_id=17

https://pubs.rsc.org/en/content/articlelanding/2021/md/d1md00114k

(無題) 削除/引用
No.11969-15 - 2023/12/03 (日) 15:01:09 - あい
けっこう自由度は大きい授業になっています。

調べて書くって言うよりかは、頑張って考えてねって感じです。

発表の期限がけっこうギリギリで焦ってしまってアイデアが欲しいです。
チートと言われればチートになってしまいます。

生体で使われる物質でその元素をSに置き換えた化合物が作られて、医療や研究試薬で使われているって具体的にどんなものがあったりしますか?
ぜんぜん無知ですみません。

(無題) 削除/引用
No.11969-14 - 2023/12/03 (日) 14:44:22 - おお
>[Re:12] あいさんは書きました :
> 授業で硫黄についての説明などはなくて、反応とかよくわからない段階です。
> S→SO→SO2→SO3などの反応させる微生物は現時点いないですか?


厳密性にこだわらなければ、あります。先の私のコメントはありますって言っているようなもんです。綿密に生物が行う反応経路を追うと、そうで無いところもありますが、そう言う代謝経路を調べて書くようなレポートなんですか?

(無題) 削除/引用
No.11969-13 - 2023/12/03 (日) 14:36:26 - おお
そうですか。それにしては自由度が大きすぎてどこまでの空想が許されるのやらって感じがします。
その上で私がアイデアを書いたらあなたのアイデアでは無いわけで、それを書いてしまってはチートみたいになりませんか?あなたの発想で書くべきもので、既にある情報を探す訳でも、高校生のテストで決まった解答があるようなものでも無い。

それに新しくと言う点においても既にヒントを書きました。Sは生体で大抵の物に使われているある元素と科学的性質がよく似ててます。実際に生体で使われる物質でその元素をSに置き換えた化合物が作られて、医療や研究試薬で使われているぐらいです。そんなものが色々と微生物が生産してくれるなら、わざわざ合成しなくてもいいし大変有用だとおもいます。

(無題) 削除/引用
No.11969-12 - 2023/12/03 (日) 14:21:15 - あい
授業で硫黄についての説明などはなくて、反応とかよくわからない段階です。
S→SO→SO2→SO3などの反応させる微生物は現時点いないですか?
もしそれでいくならどうやって進めていけばいいですか?

(無題) 削除/引用
No.11969-11 - 2023/12/03 (日) 14:15:20 - あい
既知のものじゃなくて、新しく考えなさいって課題です

(無題) 削除/引用
No.11969-10 - 2023/12/03 (日) 13:50:42 - おお
じゃあ既に複数のSuggestionをしてます。

(無題) 削除/引用
No.11969-9 - 2023/12/03 (日) 12:45:43 - あい
課題の全文はこんな感じです。
独)〇〇研究開発機構に所属する研究員のあなたは元素✕の地球化学的循環について研究を行っています。
あなたは地球規模の調査によって微生物が駆動する元素✕の新たな物質変換経路を発見しました。
さて、元素✕とは何ですか?(周期表から選択・複数可)
新たな物質変換経路とはどんな反応ですか?
その反応はどんな微生物がどんな機構で行いますか?

(無題) 削除/引用
No.11969-8 - 2023/12/03 (日) 11:55:24 - おお
>[Re:6] おおさんは書きました :

> 全て新しい事ではありません。発見にも値しないと思います。
>
> その発見というのはあなたたちが知らないけど既知の事を調べなさいという事ですか?

いや、でもアイデアって言ってるからなぁ。既知のことにアイデアも何も無いだろうし。

(無題) 削除/引用
No.11969-7 - 2023/12/03 (日) 10:46:07 - おお
硫黄細菌っていうのもあるね。

(無題) 削除/引用
No.11969-6 - 2023/12/03 (日) 10:39:06 - おお
全然新しい事ではないので、役に立たんと思うけど、H2Oの代わりにH2Sを使う光合成細菌がいます。
土壌など環境に存在する硫黄化合物は、生物を除けば大抵硫酸(塩)です。しかしながら、生物の中では多様な硫黄化合物が存在します。そのような硫黄化合物はどのようにして作られるのでしょうか。

全て新しい事ではありません。発見にも値しないと思います。

その発見というのはあなたたちが知らないけど既知の事を調べなさいという事ですか?

(無題) 削除/引用
No.11969-5 - 2023/12/03 (日) 08:51:56 - 考える
よくわからんけど乗ってみるか。

未知の微生物の発見を重視すれば
既知の反応に縛られる必要がないから適当に
無理やり酸素をくっつける酵素を持つ微生物がいましたとして
S→SO→SO2→SO3
みたいになんちゃって化合物を自作すればいいじゃない

とこれだと妄想すぎるから
授業で習った、ないし既知の微生物の反応を調べて
その反応経路の範囲内で化合物が変わっていく系を書けばいいじゃない
ただし発見うんぬんは意味ない。

元素すら選択性なら
採点するほうもいちいち各元素の正しい反応について正誤を判定できるか怪しい
すべての元素の未知の反応で正しく機能する経路を
宿題レベルでぽんぽん提示できる優秀な教員がいれば別だけど。

(無題) 削除/引用
No.11969-4 - 2023/12/03 (日) 08:05:14 - あい
宿題の意図としては硫黄が含まれた物質が微生物で作れるかという感じです。

例としてセレンで例えると、セレン酸→亜セレン酸、亜セレン酸→元素状セレンみたいな感じです物質変換しないとダメです。

(無題) 削除/引用
No.11969-3 - 2023/12/03 (日) 07:32:23 - おお
因みに生物一般に硫黄が使われている化合物は沢山あります。

ん、宿題の意図は硫黄が含まれた(生物に関係なく)有用物質が、微生物で作れるかという事?

(無題) 削除/引用
No.11969-2 - 2023/12/03 (日) 07:27:49 - おお
案と言いながら、新たに発見されているのですか?
発見されると面白いかもと言う観点なんですか?
宿題といいますが、今までの授業とかでやったことと関連があるのでは無いですか?それならその授業を知らない人が考えたものって役に立たないですよね。

まあよくわからないままでヒントを言うと周期表で酸素の下が硫黄です。性質が似ているので、酸素を硫黄に置き換えた化合物がたくさん存在します。細胞内にどんな化合物があるかを見直せば硫黄が入る余地を創造出来るかと。

微生物 削除/引用
No.11969-1 - 2023/12/03 (日) 06:35:14 - あい
微生物による元素Xの新たな物質変換経路を発見しました。という課題で物質Xに硫黄を選びました。微生物で硫黄化合物の新たな物質変換経路で良さそうな案ないでしょうか?
宿題の期限が迫っているのですが1つもアイデアが出ずに困っています。
もしよければ一緒に考えていただきたいです。

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