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プライマーとプローブのΔGについて トピック削除
No.11971-TOPIC - 2023/12/04 (月) 12:08:25 - Ca
いつも勉強させていただいております。

リアルタイムPCRで用いるプライマーとプローブについての質問です。

プライマーとプローブを作製するときの個人的な認識として、ΔGが-9.0よりも小さくならないことを意識しているのですが、
今回作製したプローブの中にヘアピン構造でΔGが正になっているものがありました。
(IDTのサイトで確認)

今まで作製したものは全てΔGが負になっていましたので、なにか不都合がないものかと思いトピックを立てさせていただいています。
自分で調べた限りでは不都合はなさそうに思えたのですが、ご教示いただけますと幸いです。

よろしくお願いいたします。
 
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(無題) 削除/引用
No.11971-3 - 2023/12/04 (月) 16:08:51 - Ca
あああ様

言葉足らずで申し訳ありません。
ヘアピン形成におけるΔGのことを申し上げておりました。
やはりヘアピンが形成されにくいという認識で正しいのですね。
自分の認識と同じで安心しました。

ご意見ありがとうございました。

(無題) 削除/引用
No.11971-2 - 2023/12/04 (月) 13:37:52 - あああ
アニーリング時のΔGですよね?
自由エネルギー変化ΔGが正なら逆反応有利なのでそのプライマーはアニーリングして二本鎖を形成しにくい(多分しない)と思いますよ

もしヘアピン形成におけるΔGが正ならヘアピン形成しにくいということなので問題ありません

プライマーとプローブのΔGについて 削除/引用
No.11971-1 - 2023/12/04 (月) 12:08:25 - Ca
いつも勉強させていただいております。

リアルタイムPCRで用いるプライマーとプローブについての質問です。

プライマーとプローブを作製するときの個人的な認識として、ΔGが-9.0よりも小さくならないことを意識しているのですが、
今回作製したプローブの中にヘアピン構造でΔGが正になっているものがありました。
(IDTのサイトで確認)

今まで作製したものは全てΔGが負になっていましたので、なにか不都合がないものかと思いトピックを立てさせていただいています。
自分で調べた限りでは不都合はなさそうに思えたのですが、ご教示いただけますと幸いです。

よろしくお願いいたします。

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