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RNA抽出時のTRIzolによる細胞の溶解がうまくできない トピック削除
No.11972-TOPIC - 2023/12/04 (月) 20:00:39 - pom
12 well plateに播種した細胞のRNA抽出をTRIzolによって行っているのですが、plateの細胞がなかなか溶解しません。ピペッティングをしても細胞が剥がれず底に残っています。しばらく時間をおいてもあまり変わりません。TRIzolを添加してからどらくらい待つのが普通なのでしょうか。また、細胞を無駄なく回収するコツなども教えていただきたいです。
 
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No.11972-5 - 2023/12/05 (火) 02:40:15 - おお
細胞の場合私は時間は気にしてません、ピペッティングでなんとかするか、チップの先で擦るか。
気になるならスクレーパーとか使ってもいいかと思います。RNA抽出用に何本かキープして再利用してもいいかもしれません(フェノールなどのWasteをどうするかというのはありますが)。

(無題) 削除/引用
No.11972-4 - 2023/12/05 (火) 00:53:00 - あの
Trizolの処理時間は、組織からの抽出の際には15分ぐらいは置くので、
プレート底全面にかかっているなら、細胞でもそのぐらい置いても大丈夫と考えています。

節約したいときは、少なくとも底面積の70%ぐらいはかかっているようにして、手で揺すりながら、チップで引っ掻きます。

プレートの数が多くて、人手が足りないときは、時間などは結構 ばらついても気にしないことにしています。

シェーカーやボルテックスの時間も、1分前後にしていますが、ばらついても気にしないことにしています。


ちなみに、RNAの収量に影響するのは、チューブ等への吸着ロスと、アルコール沈殿の沈殿物の量です。低吸着グレードのチップやマイクロチューブ、ニッポンジーン社のエタチンメイトの使用をしています。

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No.11972-3 - 2023/12/04 (月) 23:15:38 - pom
あのさんご回答ありがとうございます。trizol添加後の時間はあまり関係ないのでしょうか?また、プレートシェイカーやボルテックスはどれくらいしたらいいですか?

(無題) 削除/引用
No.11972-2 - 2023/12/04 (月) 23:04:44 - あの
プレートごと、プレートシェーカー(あるいは普通のボルテックス)で撹拌する。

それから、チップなどで、ひっかく。タテヨコ、のの字で。

RNA抽出時のTRIzolによる細胞の溶解がうまくできない 削除/引用
No.11972-1 - 2023/12/04 (月) 20:00:39 - pom
12 well plateに播種した細胞のRNA抽出をTRIzolによって行っているのですが、plateの細胞がなかなか溶解しません。ピペッティングをしても細胞が剥がれず底に残っています。しばらく時間をおいてもあまり変わりません。TRIzolを添加してからどらくらい待つのが普通なのでしょうか。また、細胞を無駄なく回収するコツなども教えていただきたいです。

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