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核酸が熱変性する液温と時間について トピック削除
No.12235-TOPIC - 2024/03/19 (火) 16:32:17 - CaC
いつも勉強させていただいております。

基本的な内容かもしれませんが、
自分で調べても答えが見つからなかったので、トピックを立てました。

一般的に核酸が熱変性する温度は90〜97℃だと思います。

時間については、個人的に100〜200bpの二本鎖DNAを想定していますので、
95℃であれば10秒holdで十分かと考えています。


しかし、これらはPCR装置での設定上の話で、
実際の液温が最低何度に到達していれば熱変性を起こすのでしょうか。
また、その際の時間はどの程度必要なのでしょうか。

ご回答いただければ幸いです。
よろしくお願いいたします。
 
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(無題) 削除/引用
No.12235-4 - 2024/03/21 (木) 09:47:05 - CaC
おお様

ご返信ありがとうございます。
確かに融解曲線分析の結果を見れば見当がつきますね。
その考えはありませんでした。

自分の過去データでもTm値が80〜85℃に収まっていたので、
80℃後半であれば熱変性を起こすのでしょうね。

その際の時間に関しては、融解曲線分析の結果からでも
数秒もあれば変性するという認識で良いでしょうか?

(無題) 削除/引用
No.12235-3 - 2024/03/20 (水) 07:19:02 - おお
温度に関してもqPCR melting curveなどで画像検索すると早いかと思いますが、だいたい80度前後のデーターが多いです。

(無題) 削除/引用
No.12235-2 - 2024/03/19 (火) 18:13:45 - おお
QPCRのメルティングカーブの条件が参考になるのでは?

0.5度/秒以下でDNAを変性させて、一本鎖に解離する温度を検出する。すなわち解離する温度に達すると即座に一本鎖になるように見える。

核酸が熱変性する液温と時間について 削除/引用
No.12235-1 - 2024/03/19 (火) 16:32:17 - CaC
いつも勉強させていただいております。

基本的な内容かもしれませんが、
自分で調べても答えが見つからなかったので、トピックを立てました。

一般的に核酸が熱変性する温度は90〜97℃だと思います。

時間については、個人的に100〜200bpの二本鎖DNAを想定していますので、
95℃であれば10秒holdで十分かと考えています。


しかし、これらはPCR装置での設定上の話で、
実際の液温が最低何度に到達していれば熱変性を起こすのでしょうか。
また、その際の時間はどの程度必要なのでしょうか。

ご回答いただければ幸いです。
よろしくお願いいたします。

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