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遺伝子改変マウスは同腹を比較しますか
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No.12442-TOPIC - 2024/07/12 (金) 12:14:33 - APC
複数のマウスを掛け合わせて、目的の遺伝子改変マウスを作成しました。ヘテロとヘテロの掛け合わせで、同腹を解析するを解析するのが定石でしょうか。あるいは、ホモWTとホモKOを維持して比較してもいいのでしょうか。複数の背景のマウスを掛け合わせており、遺伝的バックグラウンドが異なるのが気になるのですが、同腹の比較は時間も手間もかかるので、どうしたらいいのか、悩んでいます。
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No.12442-5 - 2024/07/12 (金) 20:38:06 - Tracker
HTxHT交配ペアをたくさん用意して、~1週間くらいの近い週齢として産まれてきた複数のリッターペアをプールして解析する場合が現実には多いと思います。自分の場合は1系統につき9ペアくらいはHTxHTを作っておくと、表現型解析に十分な数のWT/KOが絶えず供給されてきてうまく研究を進められています。
WTxWTとKOxKOでの表現型が↑のリッターペアでの比較で消えた経験があるので、自分は解析には使わなくなりました。
ホモ交配でとりあえず解析をするにしても、リッターペアでの再現取りは絶対にやった方がいいです。
複数の背景の系統を交配するなら尚更な気がする。。。
(無題)
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No.12442-4 - 2024/07/12 (金) 15:50:01 - おお
同腹比較を集めてpaired t test とか対応ありで統計処理もできそうだが。
(無題)
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No.12442-3 - 2024/07/12 (金) 13:20:18 - a
同腹の子は、多くて6-8匹で雌雄それぞれ3,4匹ですので、hetxhetの交配でwtとkoは1匹づつしか得られません。1匹でする試験なら良いのですが、n=6, n=8などで実施は無理です。
DOBの違いや背景の微妙な差、維持の仕方は、影響しないことを確認して許容する範囲は自分で決めるしかありません。もっと具体的なコメントをもらう場合は、どんな試験をするか書きましょう
(無題)
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No.12442-2 - 2024/07/12 (金) 12:30:35 - hjkl
同腹がbestだけど、n数の確保のことなど実験遂行上の現実的な問題もあるし、同腹でなくても許容されると思う。論文には比較は同腹でないことは明記して、そうした実験デザインの妥当性の評価は読者の判断に委ねるということで。
遺伝子改変マウスは同腹を比較しますか
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No.12442-1 - 2024/07/12 (金) 12:14:33 - APC
複数のマウスを掛け合わせて、目的の遺伝子改変マウスを作成しました。ヘテロとヘテロの掛け合わせで、同腹を解析するを解析するのが定石でしょうか。あるいは、ホモWTとホモKOを維持して比較してもいいのでしょうか。複数の背景のマウスを掛け合わせており、遺伝的バックグラウンドが異なるのが気になるのですが、同腹の比較は時間も手間もかかるので、どうしたらいいのか、悩んでいます。
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